63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1102 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  100 
 
 		 925 aa  1902    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_002950  PG0018  hypothetical protein  30.42 
 
 		 748 aa  292  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.50388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  23.66 
 
 		 854 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  23.37 
 
 		 930 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  22.9 
 
 		 905 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  20.84 
 
 		 829 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  22.65 
 
 		 816 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  23.43 
 
 		 849 aa  90.9  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  24.72 
 
 		 857 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  21.45 
 
 		 853 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  22.01 
 
 		 828 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  21.43 
 
 		 839 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  31.86 
 
 		 760 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 829 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  21.95 
 
 		 841 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  34.35 
 
 		 843 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  33.06 
 
 		 801 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3320  TonB-dependent siderophore receptor  27.94 
 
 		 807 aa  54.3  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 785 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  30.7 
 
 		 814 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 934 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  21.28 
 
 		 853 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  29.41 
 
 		 809 aa  51.6  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 763 aa  51.6  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 814 aa  51.2  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  29.1 
 
 		 856 aa  51.2  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 776 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 988 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 759 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  35.35 
 
 		 832 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 943 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  23.44 
 
 		 831 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1020  hypothetical protein  30.1 
 
 		 936 aa  49.3  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00854238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 789 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1081 aa  49.3  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 962 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2111  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 917 aa  48.9  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 778 aa  48.9  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 		 767 aa  49.3  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.7 
 
 		 1036 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6718  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 805 aa  48.1  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.960052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1511  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 772 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  26.36 
 
 		 409 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  32.2 
 
 		 1094 aa  47.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  21.49 
 
 		 877 aa  47.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 1078 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  27.72 
 
 		 872 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 809 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 810 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  24.76 
 
 		 797 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  35.9 
 
 		 1006 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  38.38 
 
 		 859 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 760 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 805 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 996 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 812 aa  45.8  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 917 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 1001 aa  45.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1552  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 1028 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1082 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  30.09 
 
 		 838 aa  45.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 808 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 763 aa  45.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>