More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1422 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1422  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
361 aa  731    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  55.43 
 
 
369 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.847548  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  53.72 
 
 
393 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  54.6 
 
 
373 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  56.27 
 
 
374 aa  384  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.88 
 
 
406 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2570  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.48 
 
 
381 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1826  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
363 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
384 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00677544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
392 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
392 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2743  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3359  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361398  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
391 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
391 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1691 aa  169  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4229  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.81 
 
 
383 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.599633  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
378 aa  161  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
383 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
386 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0809  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
367 aa  159  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 
386 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
1002 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.87 
 
 
1152 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
508 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  28.39 
 
 
544 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0492  sensor histidine kinase/response regulator  29.57 
 
 
369 aa  152  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.189978  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  32.03 
 
 
371 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
443 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 
437 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
372 aa  149  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2149  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
407 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.142048 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2590  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.413696 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 
424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
587 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
687 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2393  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 
518 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.991201  normal  0.0787545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.88 
 
 
906 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2448  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  29.18 
 
 
393 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.760608  hitchhiker  0.00120668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
1017 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.35 
 
 
837 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
508 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3391  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.86 
 
 
931 aa  143  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
404 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3550  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.65 
 
 
928 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
381 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
1002 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  27.74 
 
 
544 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
374 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6238  histidine kinase  26.98 
 
 
519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.547868  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  28.42 
 
 
528 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0931  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
446 aa  140  3e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.523505  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  30.94 
 
 
951 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 
1010 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  30.17 
 
 
547 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  33.2 
 
 
560 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 
1362 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  36.82 
 
 
1361 aa  139  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  34.21 
 
 
736 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
500 aa  139  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2715  sensor histidine kinase/response regulator  28.75 
 
 
393 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0615  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858549 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  28.88 
 
 
378 aa  139  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
511 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 
408 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
408 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0986  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.36 
 
 
921 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000725177  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2005  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
408 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
509 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
389 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2649  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4249  ATP-binding region ATPase domain protein  29.32 
 
 
374 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2414  multisensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
505 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.40518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
379 aa  137  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  34.39 
 
 
595 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3693  histidine kinase  27.25 
 
 
667 aa  137  4e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
1877 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  26.82 
 
 
598 aa  135  8e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
1014 aa  135  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1391  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
373 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540189  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
792 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3322  hybrid sensory histidine kinase BarA  33.92 
 
 
930 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000885025  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3451  hybrid sensory histidine kinase BarA  34.36 
 
 
942 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0803484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
823 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.81 
 
 
929 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1955  histidine kinase  35.89 
 
 
357 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1928  histidine kinase  35.89 
 
 
357 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
1118 aa  133  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.35 
 
 
1131 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
668 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.52 
 
 
1201 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  28.41 
 
 
816 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
406 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
379 aa  133  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  32.55 
 
 
508 aa  133  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.68 
 
 
876 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  34.65 
 
 
482 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>