More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0010 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0010  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  100 
 
 
439 aa  870  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.860595 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3752  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  61.87 
 
 
438 aa  522  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3801  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  61.87 
 
 
438 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3640  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  46.85 
 
 
434 aa  353  3e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.800892  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2731  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  46.65 
 
 
607 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0092  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  47.39 
 
 
479 aa  342  6e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2093  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  43.82 
 
 
428 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.85853e-09 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2249  secretion protein HlyD  46.34 
 
 
399 aa  332  9e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0210413  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3586  secretion protein HlyD  45.5 
 
 
474 aa  327  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.659041  normal  0.0297067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4446  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  44.64 
 
 
399 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1232  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  43.64 
 
 
444 aa  318  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  1.00981e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2890  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  43.81 
 
 
399 aa  305  1e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.447222  normal  0.499791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2587  secretion protein HlyD  40.75 
 
 
400 aa  290  5e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.897533  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3919  DevB family ABC exporter membrane fusion protein  39.86 
 
 
414 aa  278  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0601  secretion protein HlyD  42.59 
 
 
406 aa  275  1e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.986761  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4103  heterocyst specific ABC-transporter, membrane fusion protein DevB  39.45 
 
 
408 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.816007  normal  0.780206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1431  secretion protein HlyD  38.33 
 
 
361 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0330  ABC exporter membrane fusion protein, DevB family  36.3 
 
 
398 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.636273  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1224  ABC-transporter membrane fusion protein  34.93 
 
 
366 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.677987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2782  multidrug resistance efflux pump-like  27.47 
 
 
401 aa  129  9e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000623045 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4021  secretion protein HlyD  28.54 
 
 
345 aa  117  4e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10151  ABC transporter  42.75 
 
 
339 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.279055  normal  0.0324657 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0152  DevB-like secretion protein  33.99 
 
 
305 aa  113  8e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16591  ABC transporter  34.02 
 
 
294 aa  112  2e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.501795 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1252  ABC transporter  38.51 
 
 
304 aa  110  4e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07841  ABC transporter  30.63 
 
 
305 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.519134  normal  0.581316 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08361  ABC transporter  37.88 
 
 
303 aa  96.7  8e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0756  ABC transporter component-like  31.42 
 
 
304 aa  93.6  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.270032  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08091  ABC transporter  38.52 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.600867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.9 
 
 
504 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08081  ABC transporter  38.52 
 
 
304 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  30.28 
 
 
517 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1217  ABC transporter  34.66 
 
 
298 aa  88.2  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.394025  normal  0.703789 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3892  secretion protein HlyD family protein  27.78 
 
 
352 aa  87.8  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  27.79 
 
 
609 aa  82.8  1e-14  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2825  RND family efflux transporter subunit MFP  24.55 
 
 
500 aa  79  2e-13  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.708608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2861  secretion protein HlyD  28.65 
 
 
489 aa  75.9  1e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.8 
 
 
490 aa  75.5  2e-12  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3725  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 
516 aa  72  2e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.183704 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3671  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.72 
 
 
516 aa  71.2  3e-11  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3085  secretion protein HlyD family protein  24.43 
 
 
353 aa  71.2  3e-11  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  27.54 
 
 
467 aa  70.5  6e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  2.63844e-05 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0825  hypothetical protein  32.85 
 
 
364 aa  69.7  9e-11  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.99 
 
 
467 aa  69.7  1e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.74 
 
 
496 aa  69.7  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.74 
 
 
475 aa  67.8  4e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1544  secretion protein HlyD family protein  23.98 
 
 
504 aa  67.8  4e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.36 
 
 
496 aa  66.6  8e-10  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2600  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.72 
 
 
444 aa  66.2  1e-09  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  29.73 
 
 
329 aa  65.1  2e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1133  secretion protein HlyD  26.98 
 
 
371 aa  63.9  6e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.63 
 
 
400 aa  63.5  7e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  26.3 
 
 
387 aa  62.8  1e-08  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.85 
 
 
509 aa  62.8  1e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.41 
 
 
479 aa  62  2e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24 
 
 
481 aa  62.4  2e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5580  multidrug resistance protein MdtN  24.84 
 
 
349 aa  61.2  3e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3647  multidrug resistance protein MdtN  24.84 
 
 
349 aa  61.2  3e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00582079  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  24.39 
 
 
359 aa  61.2  3e-08  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4720  multidrug resistance protein MdtN  24.84 
 
 
349 aa  61.2  3e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00623543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  27.73 
 
 
449 aa  60.5  6e-08  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.95 
 
 
500 aa  60.1  7e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3533  RND family efflux transporter MFP subunit  29.81 
 
 
409 aa  60.1  7e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.722317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  28 
 
 
425 aa  59.7  9e-08  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  24.8 
 
 
400 aa  59.7  1e-07  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  27.48 
 
 
443 aa  59.3  1e-07  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  24.51 
 
 
335 aa  59.7  1e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  25.81 
 
 
356 aa  58.5  2e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
429 aa  58.5  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  24.93 
 
 
423 aa  58.5  2e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  24.18 
 
 
329 aa  58.9  2e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  25.58 
 
 
390 aa  58.9  2e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  27.44 
 
 
395 aa  58.5  2e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 
429 aa  58.2  3e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.87 
 
 
463 aa  58.2  3e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4041  hypothetical protein  29.06 
 
 
366 aa  58.2  3e-07  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0513022 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.87 
 
 
463 aa  58.2  3e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  24.84 
 
 
349 aa  58.2  3e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2319  putative secretion protein  29.02 
 
 
352 aa  57.8  4e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.97 
 
 
407 aa  57.4  5e-07  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4335  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  25.07 
 
 
443 aa  57.4  5e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526899  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  25.57 
 
 
323 aa  57.4  5e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  26.37 
 
 
441 aa  57  6e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4545  secretion protein HlyD family protein  24.68 
 
 
335 aa  57  6e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0511236  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  25.51 
 
 
383 aa  57  7e-07  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0471  secretion protein HlyD family protein  25.24 
 
 
414 aa  57  7e-07  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  28.37 
 
 
407 aa  56.6  8e-07  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  26.64 
 
 
323 aa  56.2  1e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  25.58 
 
 
335 aa  55.8  1e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  27.62 
 
 
405 aa  56.2  1e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  4.67489e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1803  secretion protein HlyD family protein  33.06 
 
 
286 aa  56.2  1e-06  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0696  secretion protein HlyD family protein  24.08 
 
 
353 aa  55.8  1e-06  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.24713 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0963  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.87 
 
 
447 aa  56.2  1e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.29 
 
 
392 aa  55.8  1e-06  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1539  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  32.26 
 
 
286 aa  55.1  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.338335  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1721  MFP family transporter  33.33 
 
 
285 aa  55.1  2e-06  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.336288  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  27.02 
 
 
500 aa  55.8  2e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 
432 aa  55.5  2e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1115  secretion protein HlyD family protein  26.96 
 
 
347 aa  55.1  2e-06  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719605  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4698  hypothetical protein  31.85 
 
 
334 aa  55.1  2e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.528303  normal  0.639413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>