More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06741 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06741  PilT2-like protein  100 
 
 
423 aa  871    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0637  twitching motility protein  70.81 
 
 
412 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5029  twitching motility protein  57.47 
 
 
428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1724  pilus retraction protein PilT  70.9 
 
 
372 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3324  twitching motility protein  61.06 
 
 
445 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416705 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3660  pilus retraction protein PilT  60.92 
 
 
431 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2777  twitching motility protein  61.06 
 
 
434 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1543  twitching motility protein  60.4 
 
 
423 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2349  twitching motility protein  58.36 
 
 
397 aa  451  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0015  twitching motility protein  57.31 
 
 
414 aa  441  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4672  twitching motility protein  53.37 
 
 
429 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0847  twitching motility protein  43.87 
 
 
370 aa  295  1e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.788432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  44.38 
 
 
358 aa  294  2e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  44.67 
 
 
356 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  45.35 
 
 
356 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  43.8 
 
 
357 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  45.4 
 
 
345 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  45.24 
 
 
345 aa  287  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  45.24 
 
 
345 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  45.24 
 
 
345 aa  287  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  43.68 
 
 
356 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  44.64 
 
 
345 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  44.94 
 
 
345 aa  286  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  44.87 
 
 
345 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  45.95 
 
 
345 aa  286  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  44.94 
 
 
345 aa  286  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  44.35 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  43.24 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  44.35 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  45.65 
 
 
344 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  44.35 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  45.1 
 
 
345 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  44.64 
 
 
345 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  43.8 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3039  type II secretion system protein (twitching motility protein) (PilT)  44.15 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.37999  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4274  twitching motility protein  45.43 
 
 
356 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  42.9 
 
 
347 aa  282  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  43.53 
 
 
349 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3883  pilus retraction protein PilT  44.14 
 
 
347 aa  280  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  44.01 
 
 
349 aa  278  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2800  pilus retraction protein PilT  44.44 
 
 
347 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0310  twitching motility protein  42.77 
 
 
347 aa  278  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  43.64 
 
 
347 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.310327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2936  twitching motility protein  44.15 
 
 
347 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.745836  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  43.52 
 
 
347 aa  276  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  43.83 
 
 
347 aa  275  9e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  41.57 
 
 
347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  43.06 
 
 
347 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  43.67 
 
 
350 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0537  twitching motility protein  42.57 
 
 
344 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3717  twitching motility protein  43.2 
 
 
347 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  43.54 
 
 
350 aa  273  3e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  43.54 
 
 
360 aa  273  3e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  43.27 
 
 
347 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03297  twitching motility protein PilT  43.62 
 
 
349 aa  272  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.987753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  43.45 
 
 
347 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0505  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  43.41 
 
 
347 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  43.07 
 
 
347 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  43.45 
 
 
347 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  42.34 
 
 
344 aa  271  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5318  pilus retraction protein PilT  42.15 
 
 
344 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  42.55 
 
 
358 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  43.77 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  41.69 
 
 
344 aa  270  4e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0342  twitching motility protein  42.38 
 
 
345 aa  270  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  43.5 
 
 
347 aa  269  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  42.81 
 
 
347 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2414  twitching motility protein  41.4 
 
 
344 aa  268  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0495  twitching motility protein PilT  42.94 
 
 
344 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05180  twitching motility protein PilT  42.94 
 
 
344 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002458  twitching motility protein PilT  42.3 
 
 
346 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  43.47 
 
 
347 aa  268  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3053  twitching motility protein  44.98 
 
 
346 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.39006  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  41.44 
 
 
344 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1131  twitching motility protein  42.64 
 
 
360 aa  266  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.809253  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1609  twitching motility protein  43.37 
 
 
345 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.409997 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03577  hypothetical protein  41.99 
 
 
346 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2918  twitching motility protein PilT  41.4 
 
 
344 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.683879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  42.01 
 
 
350 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  42.9 
 
 
347 aa  266  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  42.22 
 
 
347 aa  266  8e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  42.04 
 
 
344 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  41.44 
 
 
344 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0014  twitching motility protein PilT  41.69 
 
 
345 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0544  twitching mobility protein PilT, type II/IV secretion system protein  41.39 
 
 
345 aa  263  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  42.01 
 
 
350 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  41.49 
 
 
349 aa  264  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  41.49 
 
 
349 aa  264  3e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  41.57 
 
 
347 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1631  twitching motility protein  42.55 
 
 
347 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0179805 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2561  twitching motility protein  42.38 
 
 
352 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  41.12 
 
 
344 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  40.9 
 
 
397 aa  260  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  41.12 
 
 
344 aa  260  4e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0889  twitching motility protein  42.9 
 
 
351 aa  259  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0806  twitching motility protein  40.52 
 
 
360 aa  259  6e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03090  Pilus retraction protein  40.54 
 
 
344 aa  259  7e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.166876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1802  twitching motility protein  41.04 
 
 
369 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.579397 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  42.82 
 
 
360 aa  259  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06901  twitching motility protein  41.64 
 
 
357 aa  259  9e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.595138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>