60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4612 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  100 
 
 
714 aa  1428    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  61.74 
 
 
1026 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  59.95 
 
 
826 aa  428  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  60.59 
 
 
721 aa  423  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  62.64 
 
 
1178 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  62.92 
 
 
633 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  63.85 
 
 
810 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  60.4 
 
 
1126 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  56.33 
 
 
920 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  59.26 
 
 
805 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.9 
 
 
540 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.99 
 
 
408 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  60.23 
 
 
701 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  57.53 
 
 
1255 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  51.3 
 
 
640 aa  363  7.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.38 
 
 
1221 aa  360  5e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.36 
 
 
1383 aa  351  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  57.19 
 
 
1848 aa  350  6e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  52.89 
 
 
884 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.91 
 
 
1607 aa  348  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  57.46 
 
 
2802 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.86 
 
 
887 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  53.82 
 
 
1195 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.3 
 
 
1130 aa  337  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50 
 
 
1183 aa  324  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.58 
 
 
1507 aa  316  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.11 
 
 
664 aa  311  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  59.46 
 
 
1285 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  43.78 
 
 
1176 aa  294  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  48.26 
 
 
1292 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  48.15 
 
 
862 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  46.04 
 
 
791 aa  280  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.85 
 
 
1176 aa  269  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  46.41 
 
 
3563 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  49.11 
 
 
933 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  45.98 
 
 
462 aa  249  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  46.88 
 
 
648 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  41.83 
 
 
288 aa  188  4e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  44.17 
 
 
1083 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3988  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  39.64 
 
 
601 aa  127  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  47.1 
 
 
826 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  46.4 
 
 
726 aa  103  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  34.12 
 
 
1969 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  42.27 
 
 
14944 aa  70.5  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  44.58 
 
 
2003 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  36.26 
 
 
1132 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.61 
 
 
1362 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  33.73 
 
 
1550 aa  55.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  38.75 
 
 
441 aa  50.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3763  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  32.45 
 
 
387 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  33.33 
 
 
470 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  39.13 
 
 
1216 aa  48.9  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  30.32 
 
 
1100 aa  48.5  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  45.07 
 
 
775 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  35.09 
 
 
532 aa  48.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 
972 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  42.37 
 
 
1976 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  30.59 
 
 
633 aa  45.8  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0432  hypothetical protein  25.61 
 
 
1002 aa  45.1  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.259517  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  35.48 
 
 
1170 aa  45.1  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>