More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4590 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 224 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3853  GntR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000435819  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 230 aa  95.9  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 232 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.65 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  32.12 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0430  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 235 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0615592  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 228 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  30.77 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.05 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 241 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 234 aa  88.6  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  31.77 
 
 		 223 aa  88.2  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  32.16 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 226 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 262 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3622  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 247 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 219 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2268  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6033  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 239 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.38 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4357  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 240 aa  85.1  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.899298  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  32.81 
 
 		 219 aa  85.1  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  31.79 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  26.86 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6266  transcriptional regulator, GntR family  31.6 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316911  normal  0.300787 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1462  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0833  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2149  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.577726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1846  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0422  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0519  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2102  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0736867  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4670  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>