More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0595 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 
247 aa  497  1e-140  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  1.58145e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  74.63 
 
 
228 aa  326  2e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1483  50S ribosomal protein L3  70.39 
 
 
219 aa  299  3e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.63613e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  69.52 
 
 
210 aa  283  2e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.19433e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
210 aa  275  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  8.42867e-10  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
210 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.05997e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
210 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  5.51418e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
210 aa  275  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  7.75669e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
210 aa  275  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  2.46604e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
210 aa  275  4e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.41135e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
210 aa  275  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  9.86131e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
210 aa  275  4e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  1.68091e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
210 aa  275  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.67077e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  68.12 
 
 
210 aa  275  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  5.28056e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  67.15 
 
 
211 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.51121e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  64.11 
 
 
208 aa  268  8e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  3.2853e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  62.2 
 
 
209 aa  265  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.00637e-07  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  63.16 
 
 
208 aa  263  2e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  67 
 
 
213 aa  262  5e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  61.27 
 
 
223 aa  251  5e-66  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  59.8 
 
 
238 aa  240  1e-62  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.49955e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1831  50S ribosomal protein L3  57.41 
 
 
220 aa  240  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000207996  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  57.6 
 
 
220 aa  238  5e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  2.23614e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  59.51 
 
 
211 aa  236  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  3.99657e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2277  50S ribosomal protein L3  56.68 
 
 
220 aa  234  1e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  1.05261e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
211 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.94381e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  57 
 
 
209 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  1.95061e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 
210 aa  219  4e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  9.81122e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  54.81 
 
 
210 aa  215  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  7.29631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  51.44 
 
 
211 aa  209  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  3.30884e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  50.96 
 
 
209 aa  207  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  2.31855e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  52.66 
 
 
209 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  50.48 
 
 
209 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  8.24684e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  51.21 
 
 
213 aa  205  5e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  53.88 
 
 
209 aa  203  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  51.69 
 
 
209 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  3.70606e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  48.31 
 
 
210 aa  202  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  52.17 
 
 
209 aa  202  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  49.27 
 
 
212 aa  200  2e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.41734e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf444  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
272 aa  196  4e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  49.76 
 
 
209 aa  194  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  2.70125e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 
212 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  4.77342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0708  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
208 aa  189  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00455924  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 
210 aa  189  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  46.19 
 
 
215 aa  188  6e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 
210 aa  187  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.31463e-05  hitchhiker  3.31617e-13 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 
211 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.74639e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 
210 aa  182  5e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.81863e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 
212 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.33446e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
207 aa  181  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  48.37 
 
 
218 aa  181  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  49.76 
 
 
207 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  2.63563e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  46.86 
 
 
216 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3905  50S ribosomal protein L3  47.85 
 
 
223 aa  179  3e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  50 
 
 
213 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  45.97 
 
 
211 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  47 
 
 
217 aa  178  6e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  47.37 
 
 
216 aa  178  6e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 
211 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 
212 aa  178  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0691  50S ribosomal protein L3  47.29 
 
 
211 aa  178  9e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208666  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  47.37 
 
 
216 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 
207 aa  177  1e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2559  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 
211 aa  177  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  46.23 
 
 
217 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  46.63 
 
 
211 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  1.65351e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  46.23 
 
 
217 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  46.23 
 
 
217 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  46.41 
 
 
222 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 
211 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1938  50S ribosomal protein L3  48.51 
 
 
205 aa  175  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  47.06 
 
 
206 aa  175  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  2.66904e-09  hitchhiker  5.67921e-07 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 
211 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 
211 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  2.09689e-07 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  47.6 
 
 
211 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  8.38631e-08  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 
211 aa  175  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.32976e-15 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  46.23 
 
 
217 aa  174  8e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  46.89 
 
 
210 aa  174  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 
211 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  3.74535e-10  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  47.85 
 
 
217 aa  174  1e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0226  50S ribosomal protein L3  48.8 
 
 
233 aa  174  1e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  hitchhiker  0.00275796  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 
211 aa  173  2e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 
209 aa  173  2e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3703  50S ribosomal protein L3  47.55 
 
 
212 aa  172  4e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 
218 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  44.66 
 
 
210 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20870  LSU ribosomal protein L3P  44.71 
 
 
219 aa  171  8e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.235842  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  48.58 
 
 
212 aa  171  9e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  5.09154e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3012  50S ribosomal protein L3  44.04 
 
 
227 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00913494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  46.7 
 
 
212 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  45.93 
 
 
210 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  7.29954e-06 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0756  50S ribosomal protein L3  47.91 
 
 
216 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  3.85888e-10  normal  0.0180173 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0489  50S ribosomal protein L3  46.34 
 
 
206 aa  170  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.525282  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  44.83 
 
 
212 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  1.67398e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2232  50S ribosomal protein L3  46.31 
 
 
213 aa  169  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.422626 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  45.93 
 
 
219 aa  169  4e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
211 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  45.07 
 
 
218 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  45.67 
 
 
211 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  2.30335e-05  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  48.48 
 
 
209 aa  168  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>