More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0226 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  52.63 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  51.67 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  56.34 
 
 		 207 aa  210  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4026  50S ribosomal protein L3  52.13 
 
 		 210 aa  209  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000729954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0867  50S ribosomal protein L3  48.82 
 
 		 210 aa  208  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000729631  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1346  50S ribosomal protein L3  49.06 
 
 		 211 aa  205  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.700686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  205  5e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1185  50S ribosomal protein L3  52.13 
 
 		 210 aa  205  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  47.89 
 
 		 212 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1067  50S ribosomal protein L3  48.11 
 
 		 211 aa  199  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000374639  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  48.58 
 
 		 211 aa  198  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  49.53 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  46.45 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2907  50S ribosomal protein L3  52.15 
 
 		 212 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0225  ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1184  ribosomal protein L3  49.52 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000270125  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 211 aa  193  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3024  50S ribosomal protein L3  48.34 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.371217  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0790  50S ribosomal protein L3  45.75 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  48.56 
 
 		 211 aa  192  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0933  50S ribosomal protein L3  46.7 
 
 		 211 aa  191  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00137042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5079  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 211 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374535  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 210 aa  191  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0215  50S ribosomal protein L3  46.41 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000370606  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0626  ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 211 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00000165351  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4548  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 211 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00256892  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2903  50S ribosomal protein L3  46.01 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000477342  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0680  50S ribosomal protein L3  46.46 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.620206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3909  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.031884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0960  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 214 aa  189  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067151  hitchhiker  0.000000166028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4915  50S ribosomal protein L3  48.36 
 
 		 212 aa  188  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0274485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0454  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 211 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00952841  unclonable  0.000000209689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0487  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 211 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838631  normal  0.0709669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0484  50S ribosomal protein L3  47.62 
 
 		 211 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000200613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1086  LSU ribosomal protein L3P  49.76 
 
 		 217 aa  187  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.10406 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1836  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 217 aa  187  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00718997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  46.95 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  49.28 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  46.95 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0847  50S ribosomal protein L3P  48.1 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000479377  decreased coverage  0.0000116579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4749  50S ribosomal protein L3  48.1 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000212363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10020  LSU ribosomal protein L3P  47.83 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000402835  hitchhiker  0.00000000318342 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0194  50S ribosomal protein L3  48.98 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000719285  normal  0.0489845 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001742  LSU ribosomal protein L3p (L3e)  49.51 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000145621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3328  50S ribosomal protein L3  45.75 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000332976 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0320  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0285067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0626  50S ribosomal protein L3  45.02 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000331463  hitchhiker  0.000000000000331617 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  45.45 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0953  50S ribosomal protein L3  46.12 
 
 		 205 aa  184  7e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000660439  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2257  50S ribosomal protein L3  49.01 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000117498  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  49.29 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  47.45 
 
 		 213 aa  184  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4276  ribosomal protein L3  48.82 
 
 		 212 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000028687  unclonable  0.00000000000491767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2324  ribosomal protein L3  47.17 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000235705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2333  50S ribosomal protein L3  44.17 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000241734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00730  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 209 aa  182  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2174  50S ribosomal protein L3  49.03 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000029924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0286  50S ribosomal protein L3  44.55 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0410836  hitchhiker  0.00603059 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0291  50S ribosomal protein L3  45.28 
 
 		 209 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000100637  unclonable  1.4129e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  44.98 
 
 		 228 aa  181  5.0000000000000004e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2460  50S ribosomal protein L3  43.33 
 
 		 209 aa  181  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0891685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0962  ribosomal protein L3  51.69 
 
 		 206 aa  181  9.000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000608869  hitchhiker  0.0000000000269964 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  48.57 
 
 		 216 aa  181  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0837  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0361687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08850  50S ribosomal protein L3  47.14 
 
 		 211 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000230335  normal  0.0234155 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1147  50S ribosomal protein L3  46.73 
 
 		 205 aa  180  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000530687  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0397  50S ribosomal protein L3  46.63 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0323  ribosomal protein L3  48.06 
 
 		 209 aa  179  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000222247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2324  ribosomal protein L3  46.23 
 
 		 214 aa  179  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000658885  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0306  50S ribosomal protein L3P  47.87 
 
 		 222 aa  178  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207169 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0433  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 210 aa  178  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000241052  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05715  50S ribosomal protein L3  47.12 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.499117  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1851  50S ribosomal protein L3  45.21 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.722115 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  47.37 
 
 		 247 aa  178  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0451  50S ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 205 aa  178  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000154888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1138  50S ribosomal protein L3  44.39 
 
 		 207 aa  177  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000858376  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0469  50S ribosomal protein L3  45.75 
 
 		 212 aa  178  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000509154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0319  50S ribosomal protein L3  45.75 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.147880000000001e-24  hitchhiker  0.0000384813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1908  50S ribosomal protein L3  46.08 
 
 		 251 aa  177  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0000666211  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2169  50S ribosomal protein L3  46.23 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000300239  normal  0.384776 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_417  ribosomal protein L3  47.09 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000036263  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0170  50S ribosomal protein L3  47.64 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000029478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1292  50S ribosomal protein L3  43.48 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.0000167398  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>