More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0622 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 463 aa  936    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  54.95 
 
 		 472 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  54.44 
 
 		 466 aa  475  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  50.44 
 
 		 460 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  52.65 
 
 		 462 aa  441  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  48.62 
 
 		 460 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  48.67 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  51.4 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  52.28 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  50.55 
 
 		 460 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  50.23 
 
 		 473 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  49.09 
 
 		 474 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 		 456 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  48.58 
 
 		 457 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  48.87 
 
 		 480 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  48.55 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  51.05 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  45.68 
 
 		 482 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  47.74 
 
 		 472 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 462 aa  349  5e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  45.15 
 
 		 454 aa  346  4e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  45.23 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  45.01 
 
 		 460 aa  338  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  44.79 
 
 		 460 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  43.21 
 
 		 468 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  41.08 
 
 		 476 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 		 468 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 475 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 475 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  40.63 
 
 		 468 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  41.2 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  42.3 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  40.27 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 469 aa  289  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 491 aa  289  8e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  39.96 
 
 		 491 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  39.63 
 
 		 489 aa  274  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  39.73 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  35.61 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  34.02 
 
 		 463 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  34.22 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  34.29 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 463 aa  189  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  32.17 
 
 		 462 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 491 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  32.17 
 
 		 462 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 521 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  32.52 
 
 		 465 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  31.63 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.54 
 
 		 473 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  32.52 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 472 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 496 aa  176  8e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 486 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 480 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  32.29 
 
 		 466 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  30.48 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 471 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 477 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 		 443 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  29.31 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  28.26 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.53 
 
 		 477 aa  162  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  31.24 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 487 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 470 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  35.03 
 
 		 473 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  30.44 
 
 		 466 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  32.14 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  32.14 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 443 aa  158  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 434 aa  153  8e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 473 aa  150  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  29.63 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  32.6 
 
 		 470 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  30.28 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 431 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  29.26 
 
 		 424 aa  146  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  31.14 
 
 		 447 aa  146  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>