More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1420 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 472 aa  951    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  45.3 
 
 		 471 aa  340  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  41.94 
 
 		 438 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  42.2 
 
 		 425 aa  282  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  40.9 
 
 		 421 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  37.59 
 
 		 426 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  38.9 
 
 		 442 aa  246  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  38.9 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  37.91 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  36.48 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  37.91 
 
 		 418 aa  242  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  39.42 
 
 		 451 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  35.38 
 
 		 424 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  36.22 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  37.76 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  35.71 
 
 		 428 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  37.86 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  38.87 
 
 		 431 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  36.55 
 
 		 440 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  34.87 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  36.79 
 
 		 425 aa  221  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  37.34 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  38.68 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  38.29 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  38.29 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  38.29 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  38.29 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  38.29 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  38.44 
 
 		 443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  38.44 
 
 		 452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  37.18 
 
 		 423 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  37.18 
 
 		 423 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  37.18 
 
 		 423 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  37.18 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  36.34 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  35.98 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  34.97 
 
 		 443 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  36.55 
 
 		 435 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  35.73 
 
 		 439 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  35.73 
 
 		 439 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  36.81 
 
 		 408 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 423 aa  209  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  33.5 
 
 		 423 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  33.08 
 
 		 424 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  32.56 
 
 		 423 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  35.86 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  34.11 
 
 		 416 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  32.63 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  31.79 
 
 		 423 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  37.34 
 
 		 408 aa  203  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  32.05 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  37.67 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  36.46 
 
 		 417 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  36.1 
 
 		 464 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  36.1 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  30.47 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  30.49 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  28.83 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  29.37 
 
 		 448 aa  148  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  28.16 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  28.75 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  30.2 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  25.26 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  26.88 
 
 		 422 aa  130  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  29.38 
 
 		 437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  28.76 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  30 
 
 		 427 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  24.42 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  25.25 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  28.36 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  25.85 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  28.24 
 
 		 424 aa  123  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  29.46 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  29.02 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  26 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  26.87 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  26.57 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  24 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  25.87 
 
 		 432 aa  110  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.68 
 
 		 428 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  28.33 
 
 		 434 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  28.29 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2356  RND OM export protein  28.46 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  26.32 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  28.11 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  27.82 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  29.7 
 
 		 432 aa  107  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  24.62 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1541  Outer membrane efflux protein  24.55 
 
 		 486 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  28.25 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  28.77 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2075  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  26.37 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2254  Outer membrane efflux protein  28.64 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2065  chemiosmotic efflux system protein C-like protein  26.37 
 
 		 441 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2353  chemiosmotic efflux system C protein C  26.21 
 
 		 437 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2843  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 489 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0150  Outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 415 aa  97.1  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.921658  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00307  Outer membrane efflux protein  24.48 
 
 		 400 aa  96.7  9e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>