143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0952 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 184 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 184 aa  88.2  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  28.65 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  28.09 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  31.02 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0868  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  28.02 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  24.16 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3300  cystathionine beta-synthase  28.28 
 
 		 464 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  25.86 
 
 		 456 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  30.37 
 
 		 469 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  29.06 
 
 		 464 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 300 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  27.52 
 
 		 456 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3667  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  29.82 
 
 		 496 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.699338  normal  0.0676519 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  43.48 
 
 		 255 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2488  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 366 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0447094  normal  0.553019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  29.91 
 
 		 464 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  26.47 
 
 		 454 aa  48.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 688 aa  48.5  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  25 
 
 		 464 aa  48.1  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0830  CBS domain-containing protein  26.57 
 
 		 366 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1704  cystathionine beta-synthase  22.41 
 
 		 456 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1633  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  22.41 
 
 		 456 aa  47.4  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3378  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.21 
 
 		 461 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  29.75 
 
 		 461 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  27.35 
 
 		 464 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3442  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  26.21 
 
 		 461 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  27.35 
 
 		 462 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  27.35 
 
 		 464 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  27.35 
 
 		 464 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  28.57 
 
 		 303 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  32.22 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  26.67 
 
 		 464 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 141 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 252 aa  45.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  44 
 
 		 279 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0037  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  30.51 
 
 		 458 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2178  Cysteine synthase  26.12 
 
 		 466 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 77 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 255 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  27.5 
 
 		 863 aa  44.7  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1076  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  27.59 
 
 		 464 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  28.68 
 
 		 463 aa  44.7  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1021  DNA-binding protein  45 
 
 		 180 aa  44.7  0.0009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000053147  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0034  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00826547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0438  cystathionine beta-synthase  28.21 
 
 		 455 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1434  Cysteine synthase  31.53 
 
 		 453 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.700608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  25.45 
 
 		 875 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  27.59 
 
 		 455 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 259 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 67 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  42 
 
 		 279 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  26.5 
 
 		 460 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1054  cystathionine beta-synthase  27.59 
 
 		 465 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.655144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2500  XRE family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 69 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000069797  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2614  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 248 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0375  cystathionine beta-synthase  26.89 
 
 		 462 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 118 aa  43.5  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2141  helix-turn-helix domain protein  41.07 
 
 		 82 aa  43.5  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  42 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  26.98 
 
 		 303 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  42 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  42 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  42 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1844  CBS domain-containing protein  27.13 
 
 		 688 aa  43.5  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  42 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  45.24 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  45.24 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0324  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000421536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  40.82 
 
 		 377 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0894  transcriptional regulator, XRE family  42 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  26.5 
 
 		 456 aa  42.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 		 386 aa  42.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1620  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 84 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0346957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4494  putative phage repressor  31.25 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 210 aa  42  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0710  putative prophage repressor  38.78 
 
 		 245 aa  42.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 91 aa  42.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>