More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0461 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
663 aa  1289    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.49 
 
 
634 aa  1009    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.23 
 
 
606 aa  610  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.49 
 
 
597 aa  539  9.999999999999999e-153  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.02 
 
 
565 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
564 aa  223  9e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  34.09 
 
 
576 aa  174  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.75 
 
 
547 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
544 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
547 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.56 
 
 
515 aa  160  8e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 
510 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
532 aa  154  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.69 
 
 
551 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
509 aa  138  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
550 aa  137  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.18 
 
 
551 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 
579 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.31 
 
 
528 aa  127  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
572 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
601 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
547 aa  123  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  30.37 
 
 
521 aa  120  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  27.86 
 
 
560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.6 
 
 
561 aa  115  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  26.25 
 
 
516 aa  112  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
565 aa  111  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.86 
 
 
587 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  39.47 
 
 
592 aa  110  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  25.42 
 
 
516 aa  108  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24 
 
 
545 aa  108  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  26.76 
 
 
530 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
569 aa  104  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.78 
 
 
543 aa  104  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  26.32 
 
 
534 aa  103  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.21 
 
 
545 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0640  Fe3+ ABC transporter, permease  26.05 
 
 
685 aa  103  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0125154  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  27.59 
 
 
536 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  27.34 
 
 
535 aa  100  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  26.62 
 
 
535 aa  99  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.43 
 
 
563 aa  99.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  27.81 
 
 
536 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  26.62 
 
 
535 aa  99  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  27.01 
 
 
536 aa  99  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  26.62 
 
 
535 aa  99  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  27.81 
 
 
536 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  25.6 
 
 
540 aa  97.8  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  27 
 
 
536 aa  97.4  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  27.2 
 
 
536 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.36 
 
 
692 aa  97.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  27.7 
 
 
543 aa  95.5  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  25 
 
 
564 aa  95.5  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
602 aa  95.5  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0406993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  27.01 
 
 
536 aa  95.5  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  32.85 
 
 
523 aa  94.7  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  27.06 
 
 
536 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0055  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36.73 
 
 
220 aa  94  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  29.34 
 
 
555 aa  94  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  26.81 
 
 
536 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  26.75 
 
 
509 aa  92.8  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.15 
 
 
692 aa  92  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.715719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2486  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 
692 aa  92.4  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.516839  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.1 
 
 
587 aa  91.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  36.67 
 
 
504 aa  90.9  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.49 
 
 
569 aa  90.9  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  36.67 
 
 
504 aa  90.9  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1365  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.36 
 
 
692 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.87 
 
 
579 aa  89.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1922  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  31.16 
 
 
226 aa  89.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.454749  hitchhiker  0.00000014935 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.71 
 
 
512 aa  89  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.85 
 
 
554 aa  88.2  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  26.04 
 
 
514 aa  88.2  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  34.44 
 
 
504 aa  87.8  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
326 aa  87.8  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0626  iron(III) ABC transporter, permease protein  25.31 
 
 
700 aa  87.4  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  33 
 
 
535 aa  87  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.4 
 
 
742 aa  87  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  35.64 
 
 
542 aa  87  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 
728 aa  86.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.36 
 
 
551 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  27.24 
 
 
536 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.16 
 
 
545 aa  87  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1807  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.29 
 
 
732 aa  87  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2276  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.65 
 
 
541 aa  85.1  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0434  ABC transporter, permease protein  27.25 
 
 
692 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  32.2 
 
 
535 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.03 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.21 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.264999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.48 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.85 
 
 
558 aa  84.7  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.39431  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  30.88 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
600 aa  84.3  0.000000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.219645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.76 
 
 
758 aa  84.3  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.95 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.7 
 
 
569 aa  84.3  0.000000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>