More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001685 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  94.77 
 
 		 516 aa  970    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  100 
 
 		 516 aa  1031    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  67.12 
 
 		 530 aa  674    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  65.76 
 
 		 540 aa  647    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  66.27 
 
 		 534 aa  671    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  46.51 
 
 		 535 aa  422  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  46.51 
 
 		 535 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  46.51 
 
 		 535 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  50 
 
 		 536 aa  422  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  49.6 
 
 		 536 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  49.8 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  49.8 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  49.6 
 
 		 536 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  49.6 
 
 		 536 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  48.52 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  49.8 
 
 		 536 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  49.39 
 
 		 536 aa  414  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  49.19 
 
 		 536 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  48.34 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  48.13 
 
 		 536 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  48.13 
 
 		 536 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  47.09 
 
 		 535 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  47.74 
 
 		 536 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  47.74 
 
 		 536 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  47.94 
 
 		 536 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  46.9 
 
 		 535 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  47.59 
 
 		 536 aa  365  1e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  46.2 
 
 		 537 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  40.73 
 
 		 514 aa  355  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  40.84 
 
 		 509 aa  338  9e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  38.88 
 
 		 543 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  39.87 
 
 		 541 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  41.6 
 
 		 531 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  38.7 
 
 		 545 aa  282  8.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  38.19 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  37.56 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  37.23 
 
 		 542 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  37.84 
 
 		 504 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  36.95 
 
 		 504 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  38.19 
 
 		 555 aa  256  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  35.52 
 
 		 521 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.72 
 
 		 550 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.51 
 
 		 606 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 		 565 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.9 
 
 		 663 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.19 
 
 		 515 aa  99.4  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.93 
 
 		 634 aa  99.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.64 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  21.91 
 
 		 560 aa  89.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.34 
 
 		 572 aa  89.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.95 
 
 		 271 aa  87.4  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 		 512 aa  87  8e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 		 597 aa  86.7  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 		 540 aa  84.3  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0257  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  29.07 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748764  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.27 
 
 		 226 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  31.08 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.44 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.43 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  22.18 
 
 		 547 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.59 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1072  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  29.19 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.465814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.21 
 
 		 226 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  28.31 
 
 		 269 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.21 
 
 		 226 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.21 
 
 		 226 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.21 
 
 		 226 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1389  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.19 
 
 		 294 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.95 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  32.63 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  29.73 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  22.38 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2762  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  26.84 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.665279 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.03 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.2 
 
 		 273 aa  73.9  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  33.14 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0923  NifC-like ABC-type porter  28.36 
 
 		 260 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  30.51 
 
 		 226 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.94 
 
 		 226 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.94 
 
 		 226 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1021  NifC-like ABC-type porter  28.36 
 
 		 260 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1685  sulphate transport system permease protein 2  27.89 
 
 		 286 aa  72.8  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.253775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  31.89 
 
 		 338 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.38 
 
 		 509 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.31 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.92 
 
 		 579 aa  72  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2328  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  30.41 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000348346  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  28.36 
 
 		 260 aa  72  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.38 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  25.81 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.62 
 
 		 677 aa  71.6  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3627  sulfate ABC transporter inner membrane subunit  28.27 
 
 		 279 aa  70.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  25.98 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2733  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.36 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.160119 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.59 
 
 		 530 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.353247  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>