More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1199 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
555 aa  1054    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  41.91 
 
 
536 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  40.82 
 
 
535 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  40.45 
 
 
535 aa  312  7.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  40.64 
 
 
535 aa  312  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  42.12 
 
 
509 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  41.92 
 
 
536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  38.43 
 
 
516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  42.12 
 
 
536 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  41.92 
 
 
536 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  42.12 
 
 
536 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  42.32 
 
 
536 aa  306  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  42.12 
 
 
536 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  41.92 
 
 
536 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  42.12 
 
 
536 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  41.92 
 
 
536 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  41.12 
 
 
536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  41.12 
 
 
536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  41.12 
 
 
536 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  41.12 
 
 
536 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  41.12 
 
 
536 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  37.06 
 
 
516 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  41.13 
 
 
514 aa  300  4e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  42.96 
 
 
535 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  39.12 
 
 
535 aa  293  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  37.5 
 
 
540 aa  292  8e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  39.15 
 
 
535 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  36.51 
 
 
534 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  39.09 
 
 
543 aa  283  7.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  41.37 
 
 
531 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  38.9 
 
 
530 aa  278  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  42.11 
 
 
545 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  43.54 
 
 
504 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  44.05 
 
 
504 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  40.48 
 
 
537 aa  257  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  37.85 
 
 
541 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  44.05 
 
 
504 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  40.74 
 
 
536 aa  253  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  38.37 
 
 
521 aa  253  7e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  39.43 
 
 
523 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  53.2 
 
 
542 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
606 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
663 aa  120  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
550 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.4 
 
 
572 aa  117  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.3 
 
 
510 aa  115  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
597 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.3 
 
 
565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
509 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
515 aa  108  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
634 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
564 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
544 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
532 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.05 
 
 
547 aa  93.6  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
512 aa  92.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.31 
 
 
574 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.96 
 
 
547 aa  89.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  26.12 
 
 
560 aa  87  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0329  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  27.37 
 
 
574 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 
574 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 
574 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5189  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  28.38 
 
 
574 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534495  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 
540 aa  80.1  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
528 aa  78.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  28.38 
 
 
551 aa  75.1  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2052  ABC transporter, permease protein  31.33 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.667193  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4791  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000398621  hitchhiker  0.00000336758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1873  ABC transporter, inner membrane subunit  29.91 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0965334  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1549  ornithine carbamoyltransferase  32.22 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0586  ABC-type sulfate transport system, permease component  30.45 
 
 
315 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000133683  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0857  ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
315 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.020364  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0898  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
315 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00123492  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1902  PhnU  30.45 
 
 
315 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2214  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
315 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.201652  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1760  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
315 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0489  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
315 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.98 
 
 
677 aa  72  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
518 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5067  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  31.42 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517347  normal  0.476874 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
565 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0634047  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0350  ABC transporter, inner membrane subunit  29.03 
 
 
306 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0221605  normal  0.543826 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1685  sulphate transport system permease protein 2  32 
 
 
286 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.253775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5187  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 
306 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.696708 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
568 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3425  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  30 
 
 
306 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0399054 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 
225 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4970  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.03 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374231  normal  0.0875493 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.2 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.039013  normal  0.0178286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2783  ABC-type transport systems, permease component  29.91 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000474953  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6496  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  26.95 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00359807  normal  0.51818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.02 
 
 
282 aa  67.8  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01052  molybdenum ABC transporter, permease protein  31.89 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569411  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3161  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.62 
 
 
575 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.036888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3069  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0268299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.95 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1298  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.128721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>