More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0583 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  75.52 
 
 		 536 aa  730    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  74.81 
 
 		 536 aa  730    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  74.02 
 
 		 536 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  75.52 
 
 		 536 aa  730    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  77.99 
 
 		 535 aa  770    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  74.21 
 
 		 536 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  74.63 
 
 		 536 aa  731    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  77.43 
 
 		 535 aa  764    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  74.07 
 
 		 536 aa  739    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  72.39 
 
 		 535 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  74.02 
 
 		 536 aa  735    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  75 
 
 		 536 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  74.81 
 
 		 536 aa  729    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  72.39 
 
 		 535 aa  735    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  75 
 
 		 536 aa  732    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 537 aa  1040    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  75 
 
 		 536 aa  731    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  74.44 
 
 		 535 aa  708    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  74.21 
 
 		 536 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  72.2 
 
 		 535 aa  733    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  74.81 
 
 		 536 aa  734    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  82.84 
 
 		 536 aa  768    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  74.21 
 
 		 536 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  46.56 
 
 		 516 aa  422  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  45.58 
 
 		 516 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  45.2 
 
 		 540 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  47.58 
 
 		 530 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  43.03 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  42.61 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  43.52 
 
 		 543 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  42.76 
 
 		 541 aa  306  9.000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  39.46 
 
 		 509 aa  302  9e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  41.4 
 
 		 545 aa  289  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  41.88 
 
 		 531 aa  276  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  41.81 
 
 		 555 aa  259  6e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  41.05 
 
 		 523 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  37.24 
 
 		 521 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  41.09 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  40.67 
 
 		 504 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  40.38 
 
 		 504 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  40.9 
 
 		 542 aa  228  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 		 663 aa  103  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 		 606 aa  102  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 		 565 aa  99.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.8 
 
 		 634 aa  97.1  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 		 515 aa  95.5  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.82 
 
 		 544 aa  95.1  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.93 
 
 		 564 aa  94  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.31 
 
 		 550 aa  91.7  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.39 
 
 		 318 aa  90.9  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 		 225 aa  90.9  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 		 510 aa  90.1  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  21.89 
 
 		 560 aa  88.2  3e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.19 
 
 		 278 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.82 
 
 		 597 aa  84.7  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.34 
 
 		 285 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.35 
 
 		 285 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0807  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.38 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1518  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.86 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2015  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.38 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1848  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.38 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.704864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1449  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.96 
 
 		 281 aa  80.9  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.847792 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1498  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.86 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0353  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.38 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303881  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1697  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.38 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127251  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.39 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1862  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.9 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2960  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.89 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.7 
 
 		 741 aa  80.5  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  24.72 
 
 		 288 aa  79.7  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30 
 
 		 276 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  24.72 
 
 		 288 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1126  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.05 
 
 		 275 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.07 
 
 		 742 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1376  sulfate ABC transporter permease protein CysT  29.26 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3401  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.58 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2479  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.9 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5230  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.34 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2666  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.03 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0597325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1635  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.9 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4740  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.9 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00816228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.24 
 
 		 278 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.5 
 
 		 740 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1579  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.9 
 
 		 298 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1122  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.9 
 
 		 298 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1602  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.9 
 
 		 298 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.29 
 
 		 282 aa  76.6  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.69 
 
 		 291 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.62 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0292  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.72 
 
 		 272 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.48873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.7 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.37 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0309  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.64 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.14 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.27 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  24.34 
 
 		 273 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  28.14 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  30.58 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2747  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  30.58 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.67 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>