More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3415 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  74.34 
 
 
536 aa  716    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  73.97 
 
 
536 aa  712    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 
535 aa  1062    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  72.39 
 
 
537 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  99.63 
 
 
535 aa  1056    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  73.22 
 
 
536 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  73.97 
 
 
536 aa  711    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  76.64 
 
 
535 aa  776    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  74.16 
 
 
536 aa  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  73.97 
 
 
536 aa  713    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  80.56 
 
 
535 aa  800    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  73.22 
 
 
536 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  71.96 
 
 
536 aa  679    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  73.22 
 
 
536 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  76.26 
 
 
535 aa  773    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  73.22 
 
 
536 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  74.34 
 
 
536 aa  716    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  73.97 
 
 
536 aa  716    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  74.16 
 
 
536 aa  714    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  74.34 
 
 
536 aa  719    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  73.41 
 
 
536 aa  745    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  99.63 
 
 
535 aa  1058    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  73.22 
 
 
536 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  44.85 
 
 
516 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  45.74 
 
 
516 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  45.92 
 
 
530 aa  421  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  44.98 
 
 
540 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  44.12 
 
 
534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  41.57 
 
 
514 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  41.93 
 
 
509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  41.46 
 
 
543 aa  336  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  41.15 
 
 
545 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  40.86 
 
 
541 aa  312  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  40.77 
 
 
531 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  41.77 
 
 
555 aa  273  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  38 
 
 
521 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  39.92 
 
 
504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  38.93 
 
 
504 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  39.01 
 
 
504 aa  243  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  38.51 
 
 
523 aa  242  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  37.55 
 
 
542 aa  236  7e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.65 
 
 
565 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.26 
 
 
606 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
550 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.76 
 
 
634 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.92 
 
 
663 aa  101  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.59 
 
 
547 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
544 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  21 
 
 
560 aa  95.1  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
515 aa  90.5  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0489  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
315 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0857  ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
315 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.020364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1902  PhnU  29.55 
 
 
315 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0586  ABC-type sulfate transport system, permease component  29.55 
 
 
315 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000133683  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0898  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
315 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00123492  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.5 
 
 
284 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1760  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
315 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2214  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
315 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.201652  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
597 aa  88.2  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.79 
 
 
510 aa  88.2  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2052  ABC transporter, permease protein  29.96 
 
 
315 aa  87  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.667193  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3692  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.65 
 
 
291 aa  86.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.41 
 
 
285 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.41 
 
 
285 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  28.97 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.56 
 
 
222 aa  85.9  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.35 
 
 
279 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.19 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.92 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2747  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  29.91 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  29.91 
 
 
274 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.51 
 
 
288 aa  84  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.1 
 
 
283 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  27.01 
 
 
288 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
565 aa  83.2  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1685  sulphate transport system permease protein 2  28.95 
 
 
286 aa  83.2  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.253775 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.01 
 
 
288 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.33 
 
 
279 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.1 
 
 
283 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28 
 
 
289 aa  83.2  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.8 
 
 
278 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.71 
 
 
291 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2109  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.7 
 
 
284 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.81 
 
 
278 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2532  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.88 
 
 
282 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000130184  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  26.92 
 
 
288 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.5 
 
 
288 aa  79  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3401  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.36 
 
 
283 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.18 
 
 
276 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  25.59 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.59 
 
 
572 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1862  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.46 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443356  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4740  Sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00816228  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1873  ABC transporter, inner membrane subunit  28.15 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0965334  normal  0.266931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  28.07 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0807  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.05 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4791  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  29.65 
 
 
318 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000398621  hitchhiker  0.00000336758 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1848  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.05 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.704864  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1697  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.05 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0353  sulfate/thiosulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.05 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.303881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>