More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0111 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  89.93 
 
 		 536 aa  894    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  89.55 
 
 		 536 aa  893    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  73.41 
 
 		 535 aa  745    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 536 aa  1056    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  74.06 
 
 		 536 aa  696    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  73.41 
 
 		 535 aa  713    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  90.3 
 
 		 536 aa  896    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  99.63 
 
 		 536 aa  1055    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  99.81 
 
 		 536 aa  1056    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  90.3 
 
 		 536 aa  893    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  90.3 
 
 		 536 aa  895    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  74.72 
 
 		 535 aa  741    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  90.3 
 
 		 536 aa  897    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  90.49 
 
 		 536 aa  897    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  89.93 
 
 		 536 aa  894    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  73.22 
 
 		 535 aa  742    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  83.21 
 
 		 536 aa  852    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  74.21 
 
 		 537 aa  676    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  74.91 
 
 		 535 aa  743    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  90.67 
 
 		 536 aa  905    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  73.03 
 
 		 535 aa  742    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  99.44 
 
 		 536 aa  1053    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  99.44 
 
 		 536 aa  1054    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  48.13 
 
 		 516 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  46.71 
 
 		 516 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  49.29 
 
 		 530 aa  432  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  46.9 
 
 		 540 aa  422  1e-117  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  44.55 
 
 		 534 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  42.42 
 
 		 514 aa  393  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  42.83 
 
 		 543 aa  362  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  40.73 
 
 		 509 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  40.33 
 
 		 541 aa  323  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  42.3 
 
 		 545 aa  319  7.999999999999999e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  42.27 
 
 		 531 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  41.28 
 
 		 555 aa  283  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  40.12 
 
 		 542 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  39.63 
 
 		 504 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  40.45 
 
 		 504 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  39.21 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  38.05 
 
 		 523 aa  253  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  38.04 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.97 
 
 		 606 aa  108  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.82 
 
 		 544 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.68 
 
 		 663 aa  100  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.83 
 
 		 565 aa  98.6  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.02 
 
 		 634 aa  99.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  22.69 
 
 		 560 aa  96.3  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.7 
 
 		 550 aa  95.1  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.24 
 
 		 564 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.86 
 
 		 515 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.23 
 
 		 284 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  24.95 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.13 
 
 		 540 aa  84  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.8 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.43 
 
 		 532 aa  80.1  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 		 569 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.85 
 
 		 510 aa  79.7  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0309  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.76 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0121  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.74 
 
 		 288 aa  79.3  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.16 
 
 		 741 aa  79  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.53 
 
 		 278 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5844  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6756  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  27.1 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0083  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29.37 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.27 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.27 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2109  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.32 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.440331  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 		 597 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 		 512 aa  77.4  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.94 
 
 		 728 aa  77.4  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  22.85 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  22.85 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2747  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  28.64 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  28.64 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0857  ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.020364  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1902  PhnU  28.69 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2052  ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.667193  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0586  ABC-type sulfate transport system, permease component  28.69 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000133683  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0489  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1760  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2214  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.201652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0898  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 		 315 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00123492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.27 
 
 		 291 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5170  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 		 272 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451944  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.41 
 
 		 279 aa  75.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5230  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0292  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.97 
 
 		 272 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.48873 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.82 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4117  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  24.65 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.191331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5077  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.71 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  27.2 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  27.96 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.85 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4543  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.27 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1449  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.54 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.847792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.57 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3401  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.53 
 
 		 283 aa  73.6  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>