More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1141 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  82.56 
 
 
543 aa  810    Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 
541 aa  1061    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  56.66 
 
 
545 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  51.98 
 
 
531 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  47.29 
 
 
542 aa  362  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  41.03 
 
 
536 aa  349  8e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  41.08 
 
 
536 aa  332  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
536 aa  332  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  40.66 
 
 
536 aa  332  1e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  42.16 
 
 
535 aa  332  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  40.87 
 
 
536 aa  331  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  40.87 
 
 
536 aa  331  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  41.31 
 
 
536 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  41.31 
 
 
536 aa  330  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  41.88 
 
 
535 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  39.09 
 
 
516 aa  330  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  40.66 
 
 
536 aa  330  4e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  41.88 
 
 
535 aa  329  7e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  40.46 
 
 
536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  40.24 
 
 
536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  39.56 
 
 
516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  40.44 
 
 
536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  41.67 
 
 
535 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  40.24 
 
 
536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  40.04 
 
 
530 aa  327  3e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  40.24 
 
 
536 aa  326  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  40.24 
 
 
536 aa  327  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  41.55 
 
 
535 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  38.52 
 
 
514 aa  318  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  41.55 
 
 
535 aa  316  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  39.29 
 
 
540 aa  313  6.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  36.43 
 
 
534 aa  311  2e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  39.17 
 
 
509 aa  302  8.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  41.07 
 
 
536 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  42.8 
 
 
537 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  42.13 
 
 
523 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  42.32 
 
 
504 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  40.46 
 
 
504 aa  257  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  40.66 
 
 
504 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  34.99 
 
 
521 aa  238  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  38.56 
 
 
555 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.24 
 
 
540 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.34 
 
 
510 aa  99  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
532 aa  92.4  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  23.75 
 
 
592 aa  88.6  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26 
 
 
544 aa  87.8  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  22.57 
 
 
560 aa  87  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.22 
 
 
606 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.16 
 
 
572 aa  82  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  23.94 
 
 
547 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
550 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.95 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.59 
 
 
663 aa  74.7  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.26 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.44 
 
 
634 aa  72.8  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  31.55 
 
 
270 aa  72  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26 
 
 
564 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.29 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  30.37 
 
 
338 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.31 
 
 
569 aa  69.7  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.04 
 
 
547 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12427  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysT  28.47 
 
 
283 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.709467  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25 
 
 
576 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1306  molybdate ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 
268 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
285 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.02 
 
 
226 aa  65.5  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1685  sulphate transport system permease protein 2  29.61 
 
 
286 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.253775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3173  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.57 
 
 
290 aa  64.7  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357127  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  28.7 
 
 
225 aa  64.7  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  26.44 
 
 
269 aa  63.9  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.82 
 
 
226 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  28.8 
 
 
263 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.82 
 
 
226 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.82 
 
 
226 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07120  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.44 
 
 
312 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  30.95 
 
 
224 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1820  NifC-like ABC-type porter  30.05 
 
 
261 aa  62.4  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0980695  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.05 
 
 
226 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.14 
 
 
282 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0923  NifC-like ABC-type porter  26.42 
 
 
260 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.56 
 
 
249 aa  62  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.63 
 
 
263 aa  61.6  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.47 
 
 
293 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.23 
 
 
606 aa  60.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.98 
 
 
227 aa  60.5  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  26.32 
 
 
262 aa  60.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4712  Sulfate ABC transporter, permease protein CysW  28.19 
 
 
291 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000236451  normal  0.214204 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
597 aa  60.5  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2708  ABC transporter membrane spanning protein (polyamine)  30.24 
 
 
264 aa  60.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  25.36 
 
 
226 aa  60.1  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.04 
 
 
226 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1654  NifC-like ABC-type porter  28.14 
 
 
279 aa  60.1  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  27.62 
 
 
260 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.75 
 
 
728 aa  59.7  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2779  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  26.19 
 
 
263 aa  59.7  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.99 
 
 
269 aa  59.3  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000632399  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.4 
 
 
288 aa  59.3  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.42 
 
 
545 aa  59.3  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>