More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_07120  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
312 aa  619  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.77 
 
 
313 aa  368  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.758022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.11 
 
 
307 aa  359  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.01 
 
 
302 aa  351  8.999999999999999e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.48 
 
 
307 aa  346  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0372961  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5510  ABC transporter, permease protein  56.94 
 
 
292 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 
287 aa  319  3e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.71 
 
 
290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.35 
 
 
290 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306063  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4847  ABC transporter, inner membrane subunit  56.63 
 
 
289 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  decreased coverage  0.000130269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.27 
 
 
290 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.148695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.23 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.87 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.470729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.84 
 
 
295 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0758  ABC transporter, permease protein  58.59 
 
 
276 aa  294  2e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.77 
 
 
292 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.286001 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
285 aa  282  5.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.77 
 
 
138 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.73 
 
 
296 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700172  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.35 
 
 
291 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125571  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 
299 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0425652 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8171  ABC transporter membrane spanning protein  31.87 
 
 
289 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123234  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
282 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3517  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  29.96 
 
 
282 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6718  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  34.86 
 
 
307 aa  106  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170467  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  30.63 
 
 
291 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8148  ABC transporter membrane spanning protein  34.33 
 
 
293 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.46903  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
299 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
314 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342399  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
286 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  29.03 
 
 
293 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  27.31 
 
 
276 aa  99.8  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1683  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  33.2 
 
 
323 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  27.97 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  27.97 
 
 
294 aa  97.4  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.97 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
319 aa  97.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128667  normal  0.152984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.01 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
290 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62757  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.99 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.301683 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
290 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
606 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
307 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317498  normal  0.323079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.29 
 
 
593 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0497  spermidine/putrescine ABC transporter permease  29.39 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  0.264404 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.7 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3395  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  31.13 
 
 
290 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445606  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
323 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.63 
 
 
305 aa  92.8  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8305  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  28.41 
 
 
285 aa  92.4  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
283 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1835  ABC transporter, permease protein  30.83 
 
 
293 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.468029 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
669 aa  91.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1737  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.31 
 
 
276 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.81 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.81 
 
 
283 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
290 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662155  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  30.91 
 
 
284 aa  89.7  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.14 
 
 
302 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
290 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0269803  normal  0.404001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.12 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1970  sulphate transport system permease protein 2:Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.95 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.750184  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.95 
 
 
308 aa  89.7  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895819  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
587 aa  89.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 
596 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.91 
 
 
277 aa  89  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1761  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.95 
 
 
293 aa  89.4  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 
323 aa  89.4  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  27.83 
 
 
317 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.36 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3698  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  30.58 
 
 
285 aa  88.2  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2328  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  30.57 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000348346  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2707  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  28.81 
 
 
259 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139329  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.33 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.33 
 
 
278 aa  88.2  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  34.02 
 
 
284 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2704  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  26.79 
 
 
290 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03950  polyamine transport protein PotH  28.5 
 
 
293 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.45 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4468  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.28 
 
 
302 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289688  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.34 
 
 
285 aa  86.7  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00879782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.64 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.44 
 
 
278 aa  86.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1249  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  30 
 
 
277 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3433  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  30.1 
 
 
285 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400629 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.24473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1641  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.24 
 
 
279 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.07 
 
 
278 aa  85.9  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  28.04 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.36 
 
 
282 aa  85.5  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0749  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  29.64 
 
 
304 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111773  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4862  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  29 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>