More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1207 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
138 aa  267  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  99.28 
 
 
292 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.55 
 
 
292 aa  265  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.470729 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4847  ABC transporter, inner membrane subunit  98.55 
 
 
289 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  decreased coverage  0.000130269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.83 
 
 
290 aa  262  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306063  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  97.1 
 
 
290 aa  261  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.38 
 
 
290 aa  260  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.148695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.41 
 
 
295 aa  244  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.41 
 
 
292 aa  223  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.286001 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.54 
 
 
287 aa  210  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.85 
 
 
302 aa  194  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5510  ABC transporter, permease protein  67.41 
 
 
292 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0758  ABC transporter, permease protein  67.41 
 
 
276 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.9 
 
 
285 aa  159  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07120  carbohydrate ABC transporter membrane protein  63.77 
 
 
312 aa  155  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.97 
 
 
307 aa  146  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.52 
 
 
307 aa  130  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0372961  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.07 
 
 
313 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.758022  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.69 
 
 
569 aa  66.2  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.332864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381273  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0404  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183233 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
264 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
264 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.676109 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
606 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
264 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.628457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
308 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3395  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
290 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445606  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4437  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
264 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
290 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662155  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1557  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
225 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.273199  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
291 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
307 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.142547 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
307 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0707466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
741 aa  62.8  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4848  ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
310 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432693  hitchhiker  0.000811543 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8171  ABC transporter membrane spanning protein  39 
 
 
289 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123234  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
285 aa  62  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  29.46 
 
 
294 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
307 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.761483  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
296 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
307 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.04 
 
 
316 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  29.46 
 
 
294 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
307 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.46 
 
 
294 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4135  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.84 
 
 
569 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
569 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.05 
 
 
317 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
307 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
305 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.121734 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
579 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
569 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
728 aa  60.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
597 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
284 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109099  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3805  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.01 
 
 
277 aa  60.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0748  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter inner membrane protein  33 
 
 
264 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467059  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
742 aa  60.5  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
337 aa  60.5  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.33 
 
 
277 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
302 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.73 
 
 
278 aa  60.5  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2199  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.19 
 
 
284 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.133413  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4446  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
301 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1379  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.85 
 
 
266 aa  59.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.102972 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
332 aa  60.1  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
337 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
741 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
296 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.176466  normal  0.0551822 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1520  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.68 
 
 
283 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.693982  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
283 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153195  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2398  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit  50 
 
 
266 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
435 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
294 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132934  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6500  ABC transporter permease  30.47 
 
 
264 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.537768  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  42.86 
 
 
262 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
318 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2337  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.68 
 
 
283 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0669426  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  30.88 
 
 
741 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
266 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  32.89 
 
 
741 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  31.58 
 
 
288 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.58 
 
 
320 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  34.19 
 
 
293 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
312 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
318 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5840  ABC transporter membrane spanning protein (putrescine)  33.91 
 
 
265 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
569 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.91 
 
 
262 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3698  ABC sulfate/thiosulfate transporter, inner membrane subunit CysT  29.37 
 
 
285 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7724  putative sugar ABC transporter, permease protein  29.09 
 
 
312 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3142  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
325 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.406302  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1834  ABC transporter, permease protein  34.94 
 
 
269 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
416 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.27612 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
312 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481723 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
307 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3433  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.37 
 
 
285 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.400629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>