More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6370 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
318 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.77 
 
 
318 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.32 
 
 
322 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.37 
 
 
336 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.91 
 
 
301 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4988  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.43 
 
 
301 aa  245  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
291 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
314 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
313 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7824  putative ABC transporter permease protein  38.55 
 
 
295 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  34.83 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
294 aa  172  7.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  32.53 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
313 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
312 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
312 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.87 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
305 aa  166  5e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
330 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
435 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
307 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
291 aa  155  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
309 aa  155  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
300 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
295 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
299 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270687  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
310 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
294 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
310 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
289 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
299 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
289 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0940  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.81 
 
 
289 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4077  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
317 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.140823  normal  0.731226 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
289 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
291 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
289 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.42 
 
 
295 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
292 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
316 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.33 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
311 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.3 
 
 
291 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  31.02 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
307 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.92 
 
 
332 aa  145  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
328 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
286 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3226  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 
310 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 
325 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  33.2 
 
 
280 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
286 aa  144  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  32.25 
 
 
325 aa  143  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
310 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.79 
 
 
318 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
365 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
293 aa  143  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
293 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
286 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
300 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
311 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.704951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
290 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
293 aa  142  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.22308 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3143  sugar ABC transporter  35.52 
 
 
290 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.382012  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
427 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
303 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
319 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128042  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
328 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
312 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.452199  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  33.33 
 
 
286 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.19 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0257  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
291 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.958787  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
291 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.231338  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  30.36 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
291 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00180742  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7366  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.29 
 
 
278 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.97 
 
 
318 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177004  normal  0.445691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
309 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
317 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
301 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
328 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
324 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
280 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
286 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
320 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
316 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>