More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0520 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
285 aa  564  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.62 
 
 
287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.03 
 
 
290 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4847  ABC transporter, inner membrane subunit  51.66 
 
 
289 aa  291  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  decreased coverage  0.000130269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.65 
 
 
292 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.470729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.66 
 
 
290 aa  290  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306063  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.28 
 
 
292 aa  290  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.92 
 
 
290 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.148695 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5510  ABC transporter, permease protein  48.42 
 
 
292 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
302 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07120  carbohydrate ABC transporter membrane protein  49.82 
 
 
312 aa  278  8e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
292 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.286001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 
307 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0758  ABC transporter, permease protein  47.02 
 
 
276 aa  240  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.72 
 
 
313 aa  237  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.758022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 
307 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0372961  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.9 
 
 
138 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
286 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
284 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125571  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3517  ABC polyamine/opine transporter, inner membrane subunit  29.14 
 
 
282 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
282 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0280655 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  28.88 
 
 
276 aa  106  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8148  ABC transporter membrane spanning protein  32.63 
 
 
293 aa  105  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.46903  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3638  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 
291 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50975 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
283 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
299 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0425652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2578  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
283 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.946532  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.17 
 
 
606 aa  101  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6718  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.04 
 
 
307 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0170467  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
288 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7194  ABC transporter permease  28.46 
 
 
293 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2421  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  28.36 
 
 
291 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0858  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
308 aa  98.6  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.895819  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
587 aa  98.2  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.432532 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000517697  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
299 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.807342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.700172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1542  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  30.38 
 
 
281 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5471  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
588 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
593 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1581  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.68 
 
 
285 aa  93.6  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.11 
 
 
297 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
569 aa  93.6  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4688  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.84 
 
 
279 aa  92.8  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.853337  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.94 
 
 
269 aa  92.4  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
740 aa  92  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2371  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
275 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109992  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.84 
 
 
286 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1466  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  28.62 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.57 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8171  ABC transporter membrane spanning protein  28.35 
 
 
289 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123234  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.5 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0269803  normal  0.404001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.844332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4967  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
319 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.128667  normal  0.152984 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2704  spermidine/putrescine ABC transporter inner membrane protein  26.5 
 
 
290 aa  89.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.382039  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  35.26 
 
 
286 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.88 
 
 
290 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.38 
 
 
274 aa  89  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.301683 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1106  polyamine ABC transporter, permease protein, putative  31.63 
 
 
271 aa  88.2  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1683  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  29.75 
 
 
323 aa  88.2  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
241 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.75 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0489699  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.83 
 
 
569 aa  87.8  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0497  spermidine/putrescine ABC transporter permease  24.62 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157918  normal  0.264404 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1237  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 
308 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.407263  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8305  ABC transporter membrane spanning protein (mannopine)  28.7 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.44 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657903  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27 
 
 
742 aa  86.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.88 
 
 
305 aa  87  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.62 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
597 aa  85.9  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 
274 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0620959  normal  0.806351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.24 
 
 
303 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.07 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.150151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4468  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.79 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.289688  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3395  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  29.49 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.445606  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0631  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  26.52 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000147089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.24 
 
 
743 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.58 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.134658 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.22 
 
 
591 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621124  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.75 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132934  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1861  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  32.92 
 
 
286 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.07 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.82 
 
 
596 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0394  polyamine transport protein PotH  31.19 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0404  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  28.52 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.662155  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.98 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3579  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.24473  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.19 
 
 
572 aa  82.8  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6273  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.76 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317498  normal  0.323079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.21 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0734345  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  27.07 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.07 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  29.95 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>