More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1581 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1581  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  100 
 
 
285 aa  564  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003482  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotB  90.18 
 
 
286 aa  522  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000668861  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  88.42 
 
 
286 aa  518  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1038  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  84.91 
 
 
286 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000702638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2146  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  68.31 
 
 
286 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.72 
 
 
285 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000172169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2478  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.72 
 
 
285 aa  404  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.165165  normal  0.578338 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1288  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.83 
 
 
287 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1638  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.02 
 
 
285 aa  401  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1861  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.96 
 
 
286 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1245  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.72 
 
 
285 aa  404  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.332009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2001  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.72 
 
 
285 aa  404  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1566  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  68.09 
 
 
287 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000236366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1326  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.14 
 
 
287 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0226525 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1342  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.49 
 
 
287 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.377668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2141  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.49 
 
 
287 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1304  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.49 
 
 
287 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1303  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  67.48 
 
 
287 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01123  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  69.09 
 
 
275 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01131  hypothetical protein  69.09 
 
 
275 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1959  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  68.86 
 
 
277 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448664  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1158  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  60.79 
 
 
286 aa  359  4e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000395482  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.38 
 
 
308 aa  321  8e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130981  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0342  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.1 
 
 
285 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.07 
 
 
292 aa  302  4.0000000000000003e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3671  polyamine ABC transporter, permease protein  51.34 
 
 
292 aa  292  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.13 
 
 
322 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.45 
 
 
283 aa  285  8e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11898  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.53 
 
 
295 aa  280  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0871  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  51.57 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1338  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  48.09 
 
 
282 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4006  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  48.09 
 
 
282 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  hitchhiker  0.00000000961653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1200  spermidine/putrescine ABC transporter permease  46.56 
 
 
282 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163674  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1298  spermidine/putrescine ABC transporter permease  46.56 
 
 
282 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.15 
 
 
293 aa  255  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.913053 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1178  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  46.56 
 
 
282 aa  250  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1180  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  46.56 
 
 
282 aa  250  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00976508  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1142  hypothetical protein  47.88 
 
 
282 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 
282 aa  250  2e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1376  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.56 
 
 
282 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078006 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1399  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.56 
 
 
282 aa  249  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291151  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.13 
 
 
281 aa  249  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1440  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  46.56 
 
 
282 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00199938  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1147  hypothetical protein  47.88 
 
 
282 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3605  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.56 
 
 
295 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0391464 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3797  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.06 
 
 
293 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.282728  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
302 aa  219  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.49 
 
 
278 aa  214  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.38 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.872266  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1802  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  42.44 
 
 
291 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
299 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.22661  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.9 
 
 
301 aa  207  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378424  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
303 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2348  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.57 
 
 
289 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00460973 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1936  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potB)-like protein  39.26 
 
 
281 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2224  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotB  39.63 
 
 
281 aa  205  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1533  polyamine transport protein PotB  41.15 
 
 
297 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.8542  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.59 
 
 
293 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.12997  normal  0.783486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17630  polyamine transport protein PotB  42.08 
 
 
297 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1610  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  41.6 
 
 
303 aa  203  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0588164  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
305 aa  202  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167031  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.433095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1016  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.55 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.725697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1272  polyamine ABC transporter, permease protein  39.49 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04240  putative permease of ABC transporter  45.97 
 
 
309 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.5 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00131035  hitchhiker  0.000000775198 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
301 aa  194  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.596967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.33 
 
 
303 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
277 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.069408  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
331 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
331 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1262  ABC-type spermidine/putrescine transport system  42.04 
 
 
322 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
323 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4673  putrescine ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
317 aa  193  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0981  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.29 
 
 
299 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
275 aa  193  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00131219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
328 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6347  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  38.06 
 
 
328 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
301 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0057841  normal  0.437411 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
301 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0768287  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2399  ABC putrescine transporter, inner membrane subunit  37.64 
 
 
297 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
301 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000446726  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
301 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
301 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
301 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90235  normal  0.0128197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
301 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0587247  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2812  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  38.06 
 
 
328 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1950  putrescine ABC transporter, permease protein  38.06 
 
 
326 aa  192  7e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.443162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
297 aa  191  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.356506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 
303 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00142926  hitchhiker  0.00113268 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1365  putative putrescine transport system permease protein  45.23 
 
 
302 aa  191  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
328 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2384  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
328 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.833701  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
328 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131392  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
296 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0764825  normal  0.0907135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511337  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.113051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
287 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0521412  hitchhiker  0.0000000382912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>