More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7724 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7724  putative sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 
312 aa  617  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0447  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.85 
 
 
303 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.873799  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.64 
 
 
323 aa  210  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0243999  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
339 aa  205  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
337 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
331 aa  182  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.618019  normal  0.983661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
337 aa  178  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
330 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.781515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1104  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.44 
 
 
334 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204963  normal  0.0432036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9092  trehalose/maltose transport inner membrane protein  36.52 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.309735  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0879036  normal  0.0396091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1046  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
308 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.03308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
325 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.97 
 
 
316 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.239085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7720  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
298 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.829271 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
337 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
332 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
296 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.01 
 
 
337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
319 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
319 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  33.77 
 
 
307 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
307 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.19 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  32.37 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
309 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
427 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
301 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2414  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.01 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.85 
 
 
310 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.1 
 
 
310 aa  135  9e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.944367  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.19 
 
 
317 aa  135  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
334 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.610005  normal  0.71076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
315 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
305 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
309 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
342 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  33.33 
 
 
292 aa  129  6e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
299 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.235202 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
299 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
435 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
292 aa  129  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0896196  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276592  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  31.34 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
319 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 
299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04590  permease component of ABC-type sugar transporter  29.79 
 
 
323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
320 aa  126  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158412  hitchhiker  0.000108715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
324 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000204062  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
312 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.55 
 
 
316 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.92 
 
 
321 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
262 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
328 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.27 
 
 
301 aa  125  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657903  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.07 
 
 
318 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
312 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  30.99 
 
 
296 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
316 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
338 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  34.15 
 
 
305 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  31.86 
 
 
293 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
293 aa  123  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.99 
 
 
313 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 
312 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
315 aa  122  5e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 
297 aa  122  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.62 
 
 
312 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.44322 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.2 
 
 
304 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
287 aa  122  6e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.688283  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
283 aa  122  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
315 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
289 aa  122  9e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
298 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1315  ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.66 
 
 
314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01288  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  30 
 
 
293 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
294 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
296 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
293 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71913  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.79 
 
 
309 aa  120  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
292 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01299  hypothetical protein  30 
 
 
293 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
316 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1426  putative sugar ABC transporter, permease protein  30 
 
 
293 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.66 
 
 
310 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>