More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4929 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
311 aa  614  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.03 
 
 
324 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57 
 
 
342 aa  316  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.01 
 
 
304 aa  314  9e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.4 
 
 
334 aa  290  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.4 
 
 
325 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  45.12 
 
 
312 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
300 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258358  normal  0.837912 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
300 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000377109 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
300 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5399  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.59 
 
 
300 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
330 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
307 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
314 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
312 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.44322 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481723 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.25 
 
 
328 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
309 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
314 aa  166  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
296 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
262 aa  165  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  hitchhiker  0.000478367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.415839 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
316 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3555  putative ABC transporter permease protein  32.98 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
427 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
324 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
291 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
312 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  34.47 
 
 
292 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
311 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.77 
 
 
296 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
315 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.48 
 
 
318 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 
328 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
296 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
312 aa  159  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
325 aa  159  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
300 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
300 aa  159  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
325 aa  159  7e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
309 aa  159  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
317 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5641  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
295 aa  158  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
303 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.693678  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
318 aa  158  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
310 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2900  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
295 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
307 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
317 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
315 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
310 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369054 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
299 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.62 
 
 
317 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
435 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
312 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
310 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
300 aa  154  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
310 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.498676  normal  0.350334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2291  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.276592  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
295 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
309 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0434884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.56 
 
 
318 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.53 
 
 
320 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0272526  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3673  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
308 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246744  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
308 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166359  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27710  permease component of ABC-type sugar transporter  33.33 
 
 
294 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
310 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0803077  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
303 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
337 aa  152  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
326 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
338 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3121  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.21 
 
 
317 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
306 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.76 
 
 
290 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
309 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
300 aa  150  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  29.74 
 
 
334 aa  149  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
289 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0438989  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 
312 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
309 aa  149  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0749  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.45 
 
 
289 aa  148  9e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
299 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.18 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.121734 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453212  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  34.62 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.88 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
299 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
316 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0699  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 
289 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.383075  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.3 
 
 
320 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
330 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0817185  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>