More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8235 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
306 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.95 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.8 
 
 
319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.255158 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.56 
 
 
289 aa  188  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.105519  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
328 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
291 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
320 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.305055  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515819  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31530  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.67 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.68002  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
330 aa  178  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
296 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.648492  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
288 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.57 
 
 
310 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
310 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4890  sugar transport system (permease)  34.66 
 
 
284 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1114  sugar ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
301 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  39.21 
 
 
312 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6934  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.73 
 
 
289 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0574886  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 
307 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
307 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.44 
 
 
334 aa  171  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
320 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
293 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00259426  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0810  ABC-type sugar transport system, permease component  35.21 
 
 
283 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.24 
 
 
354 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  35.56 
 
 
308 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
308 aa  169  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
295 aa  169  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
312 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1486  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.45 
 
 
309 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0456684  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
293 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.42 
 
 
287 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
295 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
300 aa  165  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0176  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.74 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2414  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.39 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.18 
 
 
350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.75 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199241  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  35.22 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
313 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
309 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2913  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
299 aa  163  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
309 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  36.75 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
319 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0200859  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15070  permease component of ABC-type sugar transporter  33.85 
 
 
311 aa  162  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0771026  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
305 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
313 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
338 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.335951  normal  0.466485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
318 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
287 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.484603  normal  0.727796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0238  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
329 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
298 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  38.46 
 
 
288 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
297 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000488765  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
310 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
328 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2715  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.98 
 
 
350 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392142  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
313 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  33.09 
 
 
294 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
294 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  33.09 
 
 
294 aa  159  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
332 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27710  permease component of ABC-type sugar transporter  33.68 
 
 
294 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
309 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
318 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.106475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
283 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
312 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
315 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.18898  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  33.88 
 
 
317 aa  158  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.26 
 
 
319 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
327 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744275  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
315 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  32.33 
 
 
305 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
307 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
320 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
309 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.114297  normal  0.0929805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  38.81 
 
 
287 aa  156  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.37 
 
 
320 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
333 aa  156  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.276283  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
317 aa  156  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.156333  normal  0.563407 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
292 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.153616  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0022  ABC-type sugar transport system, permease component  35.23 
 
 
284 aa  156  5.0000000000000005e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000144721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
300 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0038089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  34.48 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
402 aa  156  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
319 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>