More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5668 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
315 aa  622  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.66 
 
 
307 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
262 aa  178  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
307 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
316 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  33.56 
 
 
312 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
301 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657903  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
318 aa  169  7e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
325 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  36.62 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
314 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
330 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
307 aa  162  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
299 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
320 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
324 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.67 
 
 
317 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
309 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
317 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  hitchhiker  0.000478367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
296 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
294 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
311 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.13 
 
 
328 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
291 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
315 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0566045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
318 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.415839 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
299 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
314 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  33.76 
 
 
325 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
319 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 
325 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
312 aa  155  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
315 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.96 
 
 
317 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5641  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3555  putative ABC transporter permease protein  31.69 
 
 
317 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
320 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  35.82 
 
 
312 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
328 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  33.57 
 
 
292 aa  153  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
317 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
290 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0463372  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
310 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369054 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
310 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.15 
 
 
310 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
286 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
306 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
324 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
292 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
309 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
314 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
312 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.44322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
291 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.476032  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
283 aa  149  5e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
334 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
315 aa  148  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.511569  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  35.94 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.85 
 
 
311 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
315 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
299 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.91 
 
 
312 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.376983 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01288  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  32.73 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01299  hypothetical protein  32.73 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71913  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1426  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.73 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
309 aa  145  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
286 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.02 
 
 
319 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
316 aa  145  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 
296 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
293 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.35 
 
 
318 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
316 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
297 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
317 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
316 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
296 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
320 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0272526  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  35.71 
 
 
300 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
312 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
365 aa  143  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
304 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
293 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.102296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
303 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.916696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1956  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 
293 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.798746  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1811  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 
293 aa  143  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1521  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.36 
 
 
293 aa  143  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6238  ABC transporter membrane spanning protein (maltose)  32.03 
 
 
294 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
311 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421015  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>