More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3529 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
311 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12850  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpA  60.8 
 
 
303 aa  347  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170243  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
306 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0472746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.61 
 
 
316 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 
306 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29890  carbohydrate ABC transporter membrane protein  46.13 
 
 
333 aa  238  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18860  carbohydrate ABC transporter membrane protein  44.44 
 
 
316 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.346815 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2661  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.31 
 
 
320 aa  229  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.96 
 
 
314 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal  0.200389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1529  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
318 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.165529  normal  0.149292 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
311 aa  202  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.05 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.013229  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  33.44 
 
 
307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30860  permease component of ABC-type sugar transporter  38.87 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
292 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
319 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172357  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  37.37 
 
 
305 aa  179  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.84 
 
 
320 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
318 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
318 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
307 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
312 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
309 aa  166  5e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.115668  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.7 
 
 
317 aa  162  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6025  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
305 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1315  ABC transporter, permease protein  36.56 
 
 
301 aa  161  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
318 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
308 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
291 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.01 
 
 
321 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
317 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.143445 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  33.45 
 
 
321 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
294 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
316 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
309 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
306 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4587  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
325 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.351015  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.1 
 
 
318 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790586  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.9 
 
 
308 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
304 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.68 
 
 
322 aa  154  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.899558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
319 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
305 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.825826  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
305 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.77 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
315 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0640497  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  34.47 
 
 
287 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
317 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0698  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 
310 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
313 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00226923  hitchhiker  0.00373728 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
316 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0630  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein, putative  30.33 
 
 
310 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
311 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
297 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1183  ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 
307 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
307 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2817  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  30.99 
 
 
307 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
317 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  30.94 
 
 
315 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
300 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.32 
 
 
299 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4576  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
314 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  33.57 
 
 
322 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
319 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  hitchhiker  0.000205378 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
308 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0604  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.66 
 
 
310 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
308 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
300 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0536  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease  29.72 
 
 
310 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0567  glycerol-3-phosphate ABC transporter permease protein  29.72 
 
 
310 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
315 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
313 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4735  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  28.66 
 
 
310 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
290 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00066862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  29.72 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0623  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease protein  29.72 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  29.72 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3195  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.142654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 
288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.06 
 
 
294 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  31.71 
 
 
321 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
292 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
321 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
318 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>