More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3872 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013923  Nmag_3872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
315 aa  619  1e-176  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0566045  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
286 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.262739  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
317 aa  192  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
290 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0463372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
324 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
307 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
435 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
262 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2702  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
303 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000107193  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0749  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.38 
 
 
289 aa  166  5e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3673  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.06 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246744  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166359  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0699  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.383075  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
316 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
309 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
324 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
307 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
312 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0404  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.13 
 
 
294 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
299 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
289 aa  157  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0438989  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
314 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.453212  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
296 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3229  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
314 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
317 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5641  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  32.57 
 
 
312 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  34.26 
 
 
307 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
314 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
307 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  36.23 
 
 
292 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3121  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.8 
 
 
317 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
299 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369054 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
310 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.93 
 
 
318 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3555  putative ABC transporter permease protein  33.57 
 
 
317 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.34254  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3959  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
315 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
317 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  hitchhiker  0.000478367 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.415839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
296 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4517  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
300 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.177688  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.97 
 
 
296 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.62 
 
 
324 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
427 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4651  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
303 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0178947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
297 aa  150  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
294 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
307 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
365 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
315 aa  149  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
305 aa  149  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0434884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198584  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
312 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
294 aa  146  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288658  normal  0.0756683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  34.36 
 
 
312 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
310 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0803077  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.87 
 
 
328 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
291 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
304 aa  144  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.610758  normal  0.0357706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
569 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
309 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
292 aa  144  3e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
308 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  30.45 
 
 
325 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
312 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
334 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
318 aa  143  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
312 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
320 aa  143  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
293 aa  142  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000240561  normal  0.90976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.45 
 
 
569 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
301 aa  142  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
283 aa  142  6e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
317 aa  142  8e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
313 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
300 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  33.6 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 
315 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4135  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 
569 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0272526  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
286 aa  141  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.934129  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  33.6 
 
 
286 aa  140  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
294 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  29.58 
 
 
325 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 
288 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
312 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.44322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3466  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
342 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
301 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657903  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.7 
 
 
318 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
314 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000089983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
325 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>