More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0024 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
320 aa  646    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.2 
 
 
320 aa  507  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0272526  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.29 
 
 
328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  70.26 
 
 
325 aa  454  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.59 
 
 
320 aa  454  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  69.93 
 
 
325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.73 
 
 
328 aa  447  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.56 
 
 
324 aa  389  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.54 
 
 
303 aa  343  2e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.236219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0761  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.39 
 
 
320 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0629996  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0888  sugar ABC transporter, permease protein  57.32 
 
 
320 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392731  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.63 
 
 
304 aa  309  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.18 
 
 
330 aa  295  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.36 
 
 
312 aa  281  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.11 
 
 
315 aa  275  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
293 aa  255  8e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.67 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.19 
 
 
300 aa  250  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 
307 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
293 aa  249  5e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.88 
 
 
293 aa  249  5e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000240561  normal  0.90976 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.79 
 
 
293 aa  249  5e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.3 
 
 
295 aa  246  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
296 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
306 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.97 
 
 
435 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
310 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.09 
 
 
299 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 
345 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.65014 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.81 
 
 
355 aa  199  7e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
338 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0789775 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
427 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
315 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
357 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
345 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  36.55 
 
 
292 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.944367  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.91 
 
 
319 aa  183  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
330 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
315 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
301 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
262 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.35 
 
 
299 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190071 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.853442  normal  0.685254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172958  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
309 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
291 aa  169  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
318 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
310 aa  169  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11261  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter sugA  35.55 
 
 
307 aa  166  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00812399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158412  hitchhiker  0.000108715 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
312 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
331 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
388 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
299 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.610005  normal  0.71076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1042  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
292 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0233696  normal  0.724909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
307 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0281  ABC transporter, inner membrane subunit  35.27 
 
 
292 aa  159  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04590  permease component of ABC-type sugar transporter  35.81 
 
 
323 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
294 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288658  normal  0.0756683 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3673  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.44 
 
 
308 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246744  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
308 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166359  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
294 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
314 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
313 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
285 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00879782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
291 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00180742  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
316 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
294 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
294 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
300 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
300 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
329 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.339451  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
294 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20480  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.48 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0521728  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
324 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.707606 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
294 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.61386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06500  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.11 
 
 
321 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.03 
 
 
317 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  30.63 
 
 
315 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
286 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6238  ABC transporter membrane spanning protein (maltose)  32.65 
 
 
294 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.602267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
305 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
295 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
335 aa  149  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 
286 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.53 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.476032  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  33.45 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.56 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.657903  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
305 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.121734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>