More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2941 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
320 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  89.69 
 
 
325 aa  580  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  89.38 
 
 
325 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  85.08 
 
 
328 aa  540  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.09 
 
 
328 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.59 
 
 
320 aa  454  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.227719  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.31 
 
 
320 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0272526  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.52 
 
 
324 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.13 
 
 
303 aa  381  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.236219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0761  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.77 
 
 
320 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0629996  normal  0.824676 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.58 
 
 
304 aa  336  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0888  sugar ABC transporter, permease protein  57.79 
 
 
320 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392731  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.08 
 
 
330 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0590  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.11 
 
 
315 aa  288  1e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.273483  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.07 
 
 
293 aa  278  8e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000240561  normal  0.90976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.32 
 
 
312 aa  278  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.36 
 
 
297 aa  272  5.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.38 
 
 
300 aa  260  2e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000378352  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.59 
 
 
295 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.982578  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.83 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 
293 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.215175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.76 
 
 
293 aa  251  1e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0994152  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.76 
 
 
293 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.05 
 
 
296 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.87 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
310 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
435 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
299 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.03 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 
338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0789775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
319 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32149  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.2 
 
 
427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
357 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
355 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  37.76 
 
 
292 aa  191  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
309 aa  191  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
345 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.65014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
301 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
330 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
323 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
291 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00180742  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
388 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
315 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.2 
 
 
345 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
324 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
320 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.292649  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
262 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
308 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4056  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
308 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.853442  normal  0.685254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
310 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.944367  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3996  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
308 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.172958  normal  0.378531 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
310 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0634568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
310 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
312 aa  169  6e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
318 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.78 
 
 
294 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
291 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
331 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
303 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.610005  normal  0.71076 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  32.25 
 
 
312 aa  163  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.86 
 
 
316 aa  162  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
285 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00879782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
294 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.87 
 
 
311 aa  161  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04590  permease component of ABC-type sugar transporter  33.44 
 
 
323 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11261  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter sugA  34.07 
 
 
307 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00812399 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
307 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
294 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.181077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
320 aa  159  6e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.158412  hitchhiker  0.000108715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
325 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
307 aa  157  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.552621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
330 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0817185  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
317 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0281  ABC transporter, inner membrane subunit  34.47 
 
 
292 aa  157  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
329 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.339451  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  29.81 
 
 
318 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288658  normal  0.0756683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  33.44 
 
 
312 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
301 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
309 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
286 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
307 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166359  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.54 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
305 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.121734 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3673  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 
308 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
300 aa  153  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.67 
 
 
291 aa  153  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.476032  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
300 aa  153  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
319 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4556  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>