More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2820 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
305 aa  594  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0953  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.37 
 
 
292 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.568052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.42 
 
 
312 aa  248  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1755  ABC transporter permease  43.86 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.576454  normal  0.392142 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0867066 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
313 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.394829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2284  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
291 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.257134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  38.85 
 
 
318 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
299 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.270687  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
316 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2171  carbohydrate ABC transporter permease  39.27 
 
 
280 aa  201  9e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0580768  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.41 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2083  carbohydrate ABC transporter permease  38.87 
 
 
286 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0183943 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7366  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  44.8 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0828384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
309 aa  195  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
318 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.29 
 
 
307 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7824  putative ABC transporter permease protein  40.96 
 
 
295 aa  193  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
294 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
318 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
294 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
296 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
286 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.771132  normal  0.363599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1261  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.23 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196832  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.12 
 
 
316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
295 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0832027  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
320 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.974377  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
314 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0305  sugar ABC transporter, permease protein  37.19 
 
 
325 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474821  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.69 
 
 
310 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
287 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 
301 aa  178  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0280  sugar ABC transporter, permease protein  36.27 
 
 
325 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
435 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
293 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
328 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0949  permease protein of sugar ABC transporter  40.07 
 
 
292 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688345  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  38.1 
 
 
293 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1742  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
292 aa  175  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.822068  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0940  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.83 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
291 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5859  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
301 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.173304  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
320 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
312 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 
288 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 
289 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
305 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
310 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0259  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
324 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 
289 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205446  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
316 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
307 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
328 aa  169  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.511246  normal  0.17987 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4988  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
301 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
334 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
307 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  36.19 
 
 
307 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1074  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 
292 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0231  sugar ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 
292 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
300 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0114019  normal  0.0892858 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0066  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 
292 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0353  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 
292 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.422375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
292 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1651  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 
292 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278367  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1233  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.98 
 
 
292 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
304 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
311 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.716912  normal  0.704951 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1178  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.85 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0204998  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.555984  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5799  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.534863  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.04 
 
 
317 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
307 aa  165  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
312 aa  165  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.633875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.80505  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2458  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.524108  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.7 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.156333  normal  0.563407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2427  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.626108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
310 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3226  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.26 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0290776  normal  0.498538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2279  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.06 
 
 
292 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
365 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.482665  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2833  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
319 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0200859  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
326 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>