More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02940 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
318 aa  636    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.64 
 
 
312 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.44322 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5212  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.67 
 
 
312 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481723 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01820  permease component of ABC-type sugar transporter  33.65 
 
 
312 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.77 
 
 
283 aa  180  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00790  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.772214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
316 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.130846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2109  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
312 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.376983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000108841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1885  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  41.12 
 
 
317 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.44963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
435 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
330 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0584633  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
569 aa  169  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6903  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
324 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156181  normal  0.0141251 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
296 aa  169  8e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0543799999999999e-20 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
317 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0740262  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4288  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
569 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
337 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168888 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
311 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421015  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2309  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
427 aa  165  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000129291  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0187  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
307 aa  165  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3673  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.03 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.246744  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3408  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166359  normal  0.855546 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0419  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.13 
 
 
296 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2012  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
310 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5399  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.01 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
289 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
309 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.801646 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
326 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.301949 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.62 
 
 
330 aa  162  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
328 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4135  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.89 
 
 
569 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
311 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.224374 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
319 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.198584  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
319 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243677  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
305 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
306 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.306567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.18 
 
 
354 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
300 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal  0.466467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
303 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209211  normal  0.916696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  37.1 
 
 
310 aa  159  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.65 
 
 
314 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
308 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
300 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258358  normal  0.837912 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
311 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.155715  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
304 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.707606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
338 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.781064  normal  0.179396 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
334 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.17709  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
300 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000377109 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  33.68 
 
 
311 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
332 aa  155  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
322 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
294 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3772  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
289 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
314 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0144983  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
293 aa  153  4e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
299 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
309 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.800905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
304 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.44429  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0566045  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  32.49 
 
 
320 aa  152  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
318 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
309 aa  152  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
318 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
291 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
331 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  34.05 
 
 
293 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  32.4 
 
 
293 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
317 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  hitchhiker  0.000478367 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
318 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
332 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
306 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.12 
 
 
310 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.369054 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0749  sugar ABC transporter, permease protein, putative  34.98 
 
 
289 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.444567  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
319 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.03 
 
 
299 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0821  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
314 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.09 
 
 
321 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000522199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0804  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.26 
 
 
337 aa  150  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.27 
 
 
318 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
296 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515819  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
308 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
310 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.568061 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  34.77 
 
 
294 aa  149  8e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1419  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
314 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.906597  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
308 aa  149  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
291 aa  149  8e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
333 aa  149  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.440104  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0699  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.383075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>