More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1127 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
328 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11550  carbohydrate ABC transporter membrane protein  66.03 
 
 
354 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  0.0144146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.76 
 
 
330 aa  419  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.21265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2071  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.08 
 
 
345 aa  354  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000672298  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.01 
 
 
332 aa  319  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.3 
 
 
338 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  46.41 
 
 
350 aa  292  5e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.37 
 
 
333 aa  291  9e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.276283  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2405  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.9 
 
 
294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000181172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.53 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.335951  normal  0.466485 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.77 
 
 
309 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.43514  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3250  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  42.57 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.92 
 
 
312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
312 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.746865  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.54 
 
 
302 aa  216  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.261022  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
294 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
296 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179346  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3986  putative ABC transporter (permease protein)  40.23 
 
 
313 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
309 aa  192  5e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
294 aa  192  5e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000558297  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
315 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1304  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  30.91 
 
 
334 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00913134  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  40.14 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0557  ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
308 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0541  ABC transporter, permease protein  34.75 
 
 
308 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
299 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8235  ABC transporter, permease protein  39.08 
 
 
306 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
300 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
293 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000296099  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
295 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
309 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  40.43 
 
 
305 aa  175  8e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0941  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.737632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
290 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
320 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00850  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.95 
 
 
320 aa  169  6e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  37.11 
 
 
317 aa  169  6e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
298 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
319 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
300 aa  168  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0038089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
296 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0515819  normal  0.562108 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
299 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62916  normal  0.701692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0388505  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  35.36 
 
 
293 aa  166  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
300 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2103  ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 
296 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.512676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
306 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
300 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28370  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.37 
 
 
287 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.096742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
316 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1637  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0695484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0295  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  34.33 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
306 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3816  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
327 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.744275  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2193  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
306 aa  164  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.692762  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
299 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.456499 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
302 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
297 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
315 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.89 
 
 
320 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1493  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  32.38 
 
 
319 aa  162  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
300 aa  161  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
310 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
296 aa  162  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02940  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.58 
 
 
318 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
322 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
352 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
313 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
415 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.33288  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
305 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
297 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
294 aa  159  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.431073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
296 aa  159  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000144721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
307 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.701562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1752  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
314 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000089983 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  36.88 
 
 
311 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5674  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
319 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0325503  normal  0.167 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
291 aa  158  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199241  normal  0.935882 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
295 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
297 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
294 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3105  ABC transporter, permease component  37.79 
 
 
294 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
297 aa  157  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
317 aa  157  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
317 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
289 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4157  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
289 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
289 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
289 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
301 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>