More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1735 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
328 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  58.82 
 
 
325 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  54.23 
 
 
328 aa  358  5e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.07 
 
 
335 aa  338  5.9999999999999996e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1892  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  62.67 
 
 
323 aa  328  9e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.254377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.93 
 
 
328 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.72 
 
 
309 aa  318  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.9 
 
 
334 aa  317  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.14 
 
 
322 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.06 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.073402  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.13 
 
 
324 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.52 
 
 
323 aa  302  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000203032 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0841  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  51.7 
 
 
337 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.203798 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.52 
 
 
338 aa  290  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.44 
 
 
320 aa  290  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.7 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  47.74 
 
 
379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7172  sugar transport system (permease)  49.14 
 
 
323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.88 
 
 
331 aa  281  8.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.14 
 
 
334 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  45.66 
 
 
328 aa  260  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 
326 aa  252  6e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0380307  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.07 
 
 
311 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.35 
 
 
316 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.78 
 
 
316 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.82 
 
 
322 aa  216  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396467  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0016702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
302 aa  206  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
308 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
298 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  39.32 
 
 
306 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
311 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
315 aa  192  8e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
286 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
309 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
286 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
299 aa  185  8e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.73 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  35.08 
 
 
311 aa  179  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
356 aa  178  1e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
295 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
303 aa  178  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
306 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
279 aa  176  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
293 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
305 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
293 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
291 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
325 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
315 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0640497  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
313 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06940  hypothetical protein  32.82 
 
 
329 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
318 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.22 
 
 
318 aa  165  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790586  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
296 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2034  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.963086  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
312 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
300 aa  162  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  34.29 
 
 
300 aa  162  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
300 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
296 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
294 aa  161  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
353 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  33.66 
 
 
321 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
307 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  36.86 
 
 
307 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
299 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
318 aa  159  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
321 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
296 aa  159  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.08 
 
 
293 aa  159  7e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
307 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  29.64 
 
 
315 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  38.08 
 
 
293 aa  158  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
306 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
308 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.283214  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0125  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
302 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
297 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
300 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
309 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
306 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  37.41 
 
 
287 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
299 aa  155  8e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
320 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
313 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
301 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5739  ABC transporter permease  31.03 
 
 
318 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
316 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
309 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1691  oligogalacturonide ABC tansporter, permease protein  35.4 
 
 
296 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.041328  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
296 aa  153  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.780468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>