More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2400 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
338 aa  680    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  71.65 
 
 
379 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.06 
 
 
334 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.99 
 
 
346 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.073402  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.77 
 
 
331 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.85 
 
 
365 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.69 
 
 
335 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  49.31 
 
 
328 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.56 
 
 
328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.7 
 
 
322 aa  276  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7172  sugar transport system (permease)  51.92 
 
 
323 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.86 
 
 
323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000203032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.52 
 
 
328 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  45.92 
 
 
325 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.95 
 
 
316 aa  265  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0841  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  48.99 
 
 
337 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.203798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.81 
 
 
324 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.29 
 
 
320 aa  249  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
309 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1892  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  47.93 
 
 
323 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.254377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
334 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
311 aa  222  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.69 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0380307  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.26 
 
 
322 aa  202  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
327 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
311 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0016702  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
302 aa  187  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
298 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
316 aa  180  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
299 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07100  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.36 
 
 
318 aa  175  8e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.790586  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  37.94 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
297 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
311 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
311 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06940  hypothetical protein  32.48 
 
 
329 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  36.79 
 
 
311 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
316 aa  169  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
295 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
308 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
306 aa  165  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.29 
 
 
322 aa  165  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.899558  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
306 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
299 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2875  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
318 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  0.0272583 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
291 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
299 aa  155  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
286 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
356 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
300 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
305 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277747  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 
286 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
315 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0640497  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
294 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
313 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.149421  normal  0.0970123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  32.72 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
293 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
279 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
328 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
294 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00013616  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
332 aa  145  9e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
325 aa  145  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
318 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.78 
 
 
314 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
300 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
312 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.633875  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0102  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
310 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0186923 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
420 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
309 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
420 aa  143  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  35.82 
 
 
321 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
312 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
300 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
313 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
317 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.85 
 
 
301 aa  143  5e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
293 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
312 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.541424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
333 aa  142  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.440104  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  33.82 
 
 
300 aa  142  9e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05100  permease component of ABC-type sugar transporter  32.09 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
293 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.02 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06580  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.85 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  31.63 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
301 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
283 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
309 aa  140  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>