More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2111 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
306 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
298 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  33.22 
 
 
311 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
316 aa  182  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
316 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.95 
 
 
328 aa  179  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
316 aa  177  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.2607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 
335 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  35.15 
 
 
306 aa  176  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  35.27 
 
 
328 aa  176  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
328 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
322 aa  172  5.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396467  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
299 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
308 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.88 
 
 
311 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.22 
 
 
379 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.05 
 
 
338 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254991 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
311 aa  165  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0016702  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
302 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
309 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
346 aa  162  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.073402  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
306 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.76 
 
 
279 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
322 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
315 aa  161  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.33 
 
 
328 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06940  hypothetical protein  31.77 
 
 
329 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
320 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
295 aa  159  6e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
320 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.253823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.92 
 
 
309 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  32.08 
 
 
325 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
324 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
305 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  31.38 
 
 
287 aa  157  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
323 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000203032 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
307 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  31.58 
 
 
307 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
305 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
286 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
297 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.51 
 
 
338 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.786552  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
314 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  31.44 
 
 
288 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
286 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
306 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  30.17 
 
 
321 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
293 aa  152  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29 
 
 
317 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  29.77 
 
 
350 aa  152  7e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0737  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
293 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5460  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
334 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
328 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
314 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.51197  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
295 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
334 aa  150  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.804974 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1954  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.44 
 
 
359 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
300 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.454536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7172  sugar transport system (permease)  34.49 
 
 
323 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0377247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
294 aa  149  6e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00013616  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
299 aa  149  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  32.76 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  30.17 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  31.32 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0841  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.22 
 
 
337 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.203798 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
356 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.52 
 
 
327 aa  147  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0175684  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.65 
 
 
290 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0790749  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1469  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
283 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3002  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0254  ABC-type sugar transport system, permease component  32.65 
 
 
310 aa  146  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
331 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
317 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000449996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
316 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  30.16 
 
 
305 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
299 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
328 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.00155627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
338 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.335951  normal  0.466485 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1731  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
301 aa  144  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000730006  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
300 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  30.54 
 
 
294 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.79 
 
 
301 aa  144  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
318 aa  143  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
299 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.17 
 
 
319 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
324 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000204062  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
312 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.633875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
305 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.028536  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  31.54 
 
 
317 aa  143  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
308 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84186  normal  0.48209 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
293 aa  142  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>