More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0409 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
300 aa  597  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2863  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
356 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.11 
 
 
279 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.232459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
298 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
308 aa  175  6e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172129  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2030  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
286 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453278  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
303 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000249122  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
286 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.728774  normal  0.302995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
338 aa  167  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254991 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
295 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.495335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6585  lactose transport system (permease)  36.64 
 
 
306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
328 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.913769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
294 aa  165  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
324 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.455385  normal  0.753701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0526  ABC-type sugar transport systems permease components-like  35.17 
 
 
293 aa  161  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3307  sugar transport system (permease)  33.9 
 
 
325 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0935  multiple sugar transport system permease protein  33.21 
 
 
328 aa  159  5e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.36894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
311 aa  159  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
295 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
299 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
365 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
353 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.94 
 
 
301 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
315 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0640497  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
315 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000228392  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.25 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
299 aa  156  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.175132  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4017  carbohydrate ABC transporter permease  33.09 
 
 
294 aa  156  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
294 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.46 
 
 
328 aa  155  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0926617  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
322 aa  155  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.396467  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1558  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
322 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.946878  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  33.09 
 
 
294 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  31.91 
 
 
293 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
316 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
307 aa  155  7e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
324 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000204062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1549  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  35.74 
 
 
317 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.649517  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
299 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655631 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
310 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.33 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1100  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.74 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0016702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
287 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
306 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  32.32 
 
 
294 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
306 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.157384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  35.77 
 
 
288 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  32.62 
 
 
315 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
317 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
320 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
326 aa  152  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0380307  normal  0.973635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
313 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
328 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.152171  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
323 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000203032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08410  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.45 
 
 
379 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.166742 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
293 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1786  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
335 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0186858  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
420 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
299 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000030377  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
307 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  35.46 
 
 
307 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
316 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.702273  normal  0.0136241 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4983  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  32.21 
 
 
310 aa  150  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.13 
 
 
294 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
290 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.8 
 
 
309 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
303 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.693678  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06940  hypothetical protein  32.44 
 
 
329 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
294 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4298  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
294 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.200183 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0016  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11610  permease component of ABC-type sugar transporter  34.51 
 
 
311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.117578  normal  0.102082 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.14 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
291 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
420 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2895  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
316 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0497455  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
429 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.225919  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.51 
 
 
402 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3074  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
314 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
417 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
346 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.073402  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
309 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
311 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
315 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.511569  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778687  hitchhiker  0.00185272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.69 
 
 
310 aa  145  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2535  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
314 aa  144  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3982  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
316 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
298 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
302 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>