More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1616 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
429 aa  835    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.225919  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.97 
 
 
420 aa  538  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.73 
 
 
420 aa  535  1e-151  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.96 
 
 
436 aa  509  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.88 
 
 
453 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.29 
 
 
294 aa  226  6e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.550241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
309 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3990  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
317 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0477  ABC tranporter, permease protein  44.54 
 
 
315 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
417 aa  192  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.636087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
415 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.33288  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.69 
 
 
299 aa  190  5e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.74 
 
 
299 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.426381  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
291 aa  187  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0196347  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.03 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1549  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.563461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00881  ABC transporter sugar permease  40.55 
 
 
294 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0244413  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.66 
 
 
294 aa  182  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.39 
 
 
353 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500594  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1606  ABC transporter sugar permease  39.83 
 
 
293 aa  179  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
292 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.219562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.64 
 
 
292 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1900  sugar ABC transporter, permease protein, putative  51.72 
 
 
314 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1635  sugar ABC transporter, permease  51.72 
 
 
314 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
296 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2208  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
306 aa  178  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.739705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
293 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990678  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3227  extracellular solute-binding protein family 1  39.91 
 
 
307 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00159401  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
307 aa  177  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.556907  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
297 aa  176  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2365  sugar ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 
288 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.216835  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0461  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.67 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
295 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000506379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27700  permease component of ABC-type sugar transporter  39.74 
 
 
321 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.479477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21160  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.5 
 
 
314 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.103465  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
314 aa  172  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000200699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0728  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.86 
 
 
313 aa  170  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000239391  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
310 aa  170  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2292  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
306 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.12 
 
 
285 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.168129  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
316 aa  168  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.34 
 
 
313 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0625824  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
293 aa  164  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1641  ABC-type sugar transport system, permease component  39.21 
 
 
287 aa  163  6e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000401598  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7347  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  38.26 
 
 
320 aa  163  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15550  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 
294 aa  163  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2511  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.1 
 
 
317 aa  162  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.10809  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5336  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
318 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949955  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0691  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
295 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0718  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
319 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.491906  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 
318 aa  160  4e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000473727  hitchhiker  0.00124128 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2918  ABC-type sugar transport system, permease component  40.72 
 
 
305 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1290  ABC transporter, permease protein  38.79 
 
 
311 aa  160  6e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
310 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1942  sugar ABC transporter, permease protein  37.73 
 
 
287 aa  159  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1182  sugar ABC transporter, permease protein, putative  35.93 
 
 
319 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547049  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
318 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152531  normal  0.26367 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0532  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
311 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1085  putative sugar ABC transporter, permease protein  35.93 
 
 
319 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.589946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
317 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000449996 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4622  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
317 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.67 
 
 
314 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.59424  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.84 
 
 
314 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2523  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
309 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325465  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0359  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
300 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.93 
 
 
290 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal  0.307929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
316 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.637107  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00457854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
316 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.264329 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
298 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3848  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
320 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230008  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
315 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0308401  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
307 aa  156  8e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3537  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  37.34 
 
 
322 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601194  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
319 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00382098  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12077  sugar ABC transporter membrane protein  34.19 
 
 
300 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0769  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
313 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1907  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
296 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0961638  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.33 
 
 
296 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.467118  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29330  permease component of ABC-type sugar transporter  35.24 
 
 
321 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
292 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1969  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.56 
 
 
296 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000392628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
293 aa  153  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
298 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.07 
 
 
275 aa  153  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
308 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000379306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
279 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.983189  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1022  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
294 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03080  permease component of ABC-type sugar transporter  38.64 
 
 
322 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
304 aa  152  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.86 
 
 
314 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0166533  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0828  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
316 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.194369 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2465  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
296 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
352 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
303 aa  152  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.013229  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0478  glycerol-3-phosphate ABC transporter, permease  33.91 
 
 
310 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.3 
 
 
314 aa  151  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00699527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>