More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0179 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
569 aa  1056    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  72.92 
 
 
592 aa  598  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.81 
 
 
572 aa  593  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.29 
 
 
565 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.88 
 
 
601 aa  513  1e-144  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  55.76 
 
 
576 aa  448  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.78 
 
 
544 aa  445  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  54.26 
 
 
547 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.24 
 
 
547 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  54.17 
 
 
551 aa  402  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.97 
 
 
532 aa  357  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
540 aa  342  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
564 aa  304  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.92 
 
 
606 aa  240  5e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
565 aa  199  9e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
663 aa  192  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
634 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
597 aa  183  6e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
509 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.01 
 
 
510 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
528 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.33 
 
 
515 aa  154  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
550 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.21 
 
 
569 aa  121  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 
547 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  31.43 
 
 
523 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  24.47 
 
 
560 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  26.01 
 
 
509 aa  116  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  27.13 
 
 
536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  27.91 
 
 
543 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  27.24 
 
 
536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.29 
 
 
550 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.7 
 
 
563 aa  114  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  27.03 
 
 
536 aa  114  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 
579 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.84 
 
 
550 aa  113  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  27.8 
 
 
536 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  27.8 
 
 
536 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  27.85 
 
 
536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  27.85 
 
 
536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  27.8 
 
 
536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  27.8 
 
 
536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  27.8 
 
 
536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  26.76 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  27.84 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  27.64 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.71 
 
 
561 aa  110  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4609  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29 
 
 
587 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448301  normal  0.873284 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  29 
 
 
587 aa  110  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0541435 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  35.29 
 
 
277 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  35.29 
 
 
277 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  35.29 
 
 
277 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.12 
 
 
741 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  29.58 
 
 
521 aa  108  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.74 
 
 
572 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  27.03 
 
 
536 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  25.81 
 
 
535 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
563 aa  108  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.7 
 
 
743 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  27.18 
 
 
536 aa  107  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  25.81 
 
 
535 aa  106  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  25.81 
 
 
535 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  25.29 
 
 
564 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.74 
 
 
742 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3456  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.65 
 
 
277 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.421678 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  26.64 
 
 
530 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  35.68 
 
 
284 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.76 
 
 
543 aa  105  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.26 
 
 
275 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.39 
 
 
569 aa  104  4e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.62 
 
 
275 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2588  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.65 
 
 
277 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2703  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.65 
 
 
277 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.224931  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2679  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.65 
 
 
277 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2637  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.65 
 
 
277 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.848576  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2809  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.65 
 
 
277 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  26.59 
 
 
741 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.56 
 
 
758 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  25.97 
 
 
535 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1799  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  35.14 
 
 
281 aa  103  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1003  sulfate/thiosulfate transporter subunit  34.67 
 
 
277 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.566052  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1284  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  26.67 
 
 
592 aa  102  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.82 
 
 
741 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.357299  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2560  sulfate/thiosulfate transporter subunit  32.7 
 
 
277 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  25.26 
 
 
535 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  21.81 
 
 
514 aa  101  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.35 
 
 
677 aa  101  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02324  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.17 
 
 
277 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1237  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
277 aa  100  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3654  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02285  hypothetical protein  33.17 
 
 
277 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2579  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2710  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  100  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2796  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.33 
 
 
277 aa  100  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1255  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.17 
 
 
277 aa  100  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009131 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  26.42 
 
 
741 aa  100  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.16 
 
 
728 aa  100  8e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.9 
 
 
586 aa  100  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  24.76 
 
 
516 aa  99.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2950  sulfate/thiosulfate transporter subunit  33.17 
 
 
277 aa  100  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.529327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>