More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0329 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 		 521 aa  993    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  54.99 
 
 		 523 aa  429  1e-119  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  57.96 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  57.76 
 
 		 504 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  53.68 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  37.76 
 
 		 530 aa  277  3e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  35.52 
 
 		 516 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  35.47 
 
 		 516 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  39.7 
 
 		 536 aa  269  8e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  37.71 
 
 		 509 aa  269  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  39.7 
 
 		 536 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  39.48 
 
 		 536 aa  267  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  38.21 
 
 		 535 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  39.48 
 
 		 536 aa  266  8e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  39.26 
 
 		 536 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  39.48 
 
 		 536 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  39.48 
 
 		 536 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  39.91 
 
 		 536 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  39.91 
 
 		 536 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  39.48 
 
 		 536 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  39.91 
 
 		 536 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  39.91 
 
 		 536 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  37.32 
 
 		 543 aa  264  3e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  39.91 
 
 		 536 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  37.99 
 
 		 535 aa  264  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  39.26 
 
 		 536 aa  263  4e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  37.77 
 
 		 535 aa  263  6.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  37.69 
 
 		 536 aa  259  9e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  34.44 
 
 		 540 aa  259  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  38.83 
 
 		 535 aa  252  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  41.01 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  34.5 
 
 		 534 aa  250  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  37.76 
 
 		 535 aa  247  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  39.52 
 
 		 535 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  38.48 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  39 
 
 		 531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  35.82 
 
 		 541 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  38.99 
 
 		 555 aa  229  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  38.95 
 
 		 536 aa  216  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  37.83 
 
 		 537 aa  211  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  30.12 
 
 		 514 aa  200  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.64 
 
 		 663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 		 634 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.42 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.32 
 
 		 510 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 		 606 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.39 
 
 		 540 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.15 
 
 		 544 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 		 597 aa  99.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 		 569 aa  93.6  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.54 
 
 		 564 aa  93.6  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.14 
 
 		 572 aa  90.9  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.48 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  26.22 
 
 		 547 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  27.1 
 
 		 576 aa  82  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.31 
 
 		 532 aa  81.3  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.46 
 
 		 222 aa  75.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  26.26 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 		 550 aa  73.9  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.38 
 
 		 528 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3530  molybdenum ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 		 225 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0290  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.95 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0282  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.95 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0289  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.95 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0093  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  30.16 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.30684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0286  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.95 
 
 		 226 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4787  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.36 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00784926  hitchhiker  0.000000216421 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1820  NifC-like ABC-type porter  28.57 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0980695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0394  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.95 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0278  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.64 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3743  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.64 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4447  molybdenum ABC transporter, permease protein  28.14 
 
 		 226 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1357  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  31.72 
 
 		 232 aa  69.7  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07120  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.9 
 
 		 312 aa  69.3  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0279  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.14 
 
 		 226 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3332  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.48 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.845298  normal  0.297479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  33.51 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0087  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.89 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  29.81 
 
 		 270 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50660  Mo transporter membrane protein, ModB1  31.75 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  31.22 
 
 		 592 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  31.03 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2747  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  31.03 
 
 		 274 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3092  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysW  28.33 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.38 
 
 		 565 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4114  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.51 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3544  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.49 
 
 		 226 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307421 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1306  molybdate ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.606425 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.64 
 
 		 677 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01290  ABC transporter, membrane spanning protein  30 
 
 		 229 aa  62.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  26.43 
 
 		 275 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1392  molybdate ABC transporter permease  28.42 
 
 		 226 aa  62.4  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.784047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1941  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.49 
 
 		 226 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2471  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 		 227 aa  62  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3829  molybdate ABC transporter inner membrane protein  27.93 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.931731 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.07 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  25.35 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>