More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  100 
 
 
592 aa  1115    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.56 
 
 
572 aa  671    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.7 
 
 
565 aa  622  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.92 
 
 
569 aa  590  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.84 
 
 
601 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  57.98 
 
 
576 aa  466  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.3 
 
 
544 aa  465  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  54.95 
 
 
547 aa  452  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  55.39 
 
 
551 aa  442  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.35 
 
 
547 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.01 
 
 
532 aa  364  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
540 aa  336  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
564 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.7 
 
 
606 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.4 
 
 
663 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
634 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.66 
 
 
597 aa  167  6.9999999999999995e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.27 
 
 
510 aa  162  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
509 aa  159  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
550 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.4 
 
 
515 aa  146  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.05 
 
 
677 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.8 
 
 
569 aa  117  6.9999999999999995e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  26.2 
 
 
509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  24.95 
 
 
560 aa  114  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  26.22 
 
 
543 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.54 
 
 
564 aa  111  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  29.83 
 
 
523 aa  110  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.68 
 
 
543 aa  108  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  25.61 
 
 
536 aa  107  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  25.61 
 
 
536 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  26.02 
 
 
536 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  26.02 
 
 
536 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  25.61 
 
 
536 aa  106  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  25.88 
 
 
536 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  25.41 
 
 
536 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  35.66 
 
 
269 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.05 
 
 
550 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  26.02 
 
 
536 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  26.02 
 
 
536 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  26.02 
 
 
536 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  25 
 
 
536 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  25.2 
 
 
536 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.87 
 
 
743 aa  103  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  25.47 
 
 
536 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.68 
 
 
550 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  20.35 
 
 
514 aa  103  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.76 
 
 
572 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  25.47 
 
 
536 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  28.44 
 
 
545 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  25.44 
 
 
530 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.32 
 
 
597 aa  101  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  25.1 
 
 
516 aa  100  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  25.11 
 
 
541 aa  100  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12427  sulfate-transport integral membrane protein ABC transporter cysT  37.31 
 
 
283 aa  100  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.709467  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  24.85 
 
 
540 aa  99.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
263 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.829399  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.86 
 
 
742 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1364  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.64 
 
 
728 aa  98.6  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  28.21 
 
 
521 aa  98.2  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  24.81 
 
 
516 aa  97.4  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  21.97 
 
 
564 aa  97.4  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  23.84 
 
 
536 aa  97.1  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.25 
 
 
278 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.74 
 
 
740 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.32 
 
 
275 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.31 
 
 
278 aa  96.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.23 
 
 
561 aa  96.7  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2679  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  33.9 
 
 
249 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.519284  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.84 
 
 
741 aa  95.1  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  33.66 
 
 
288 aa  94.7  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.33 
 
 
291 aa  95.1  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.46 
 
 
288 aa  94.7  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.53 
 
 
545 aa  94.4  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.21 
 
 
308 aa  94.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.51 
 
 
551 aa  94.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1098  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.51 
 
 
758 aa  94.4  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.18 
 
 
297 aa  94  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.687907 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1393  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.6 
 
 
284 aa  94  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  37.26 
 
 
293 aa  94  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  24.63 
 
 
535 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.7 
 
 
275 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  25.26 
 
 
535 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.27 
 
 
563 aa  93.6  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.68 
 
 
279 aa  93.6  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3173  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.23 
 
 
290 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.62 
 
 
586 aa  92.4  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  23.09 
 
 
534 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0543  ABC transporter, permease protein  25.71 
 
 
592 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.94 
 
 
289 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  24.96 
 
 
741 aa  92  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.97 
 
 
569 aa  92  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  24.13 
 
 
535 aa  91.7  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.82 
 
 
545 aa  91.7  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  24.13 
 
 
535 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.89 
 
 
308 aa  91.3  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.1 
 
 
593 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.63 
 
 
547 aa  91.3  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.13 
 
 
271 aa  90.9  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>