More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0350 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  62.87 
 
 
530 aa  648    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  64.6 
 
 
516 aa  664    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  100 
 
 
540 aa  1079    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  65.76 
 
 
516 aa  681    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  66.6 
 
 
534 aa  661    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  47.25 
 
 
536 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  46.44 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  46.86 
 
 
536 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  46.78 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  46.44 
 
 
535 aa  418  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  47.07 
 
 
536 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  47.11 
 
 
536 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  47.31 
 
 
536 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  47.31 
 
 
536 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  47.28 
 
 
536 aa  415  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  47.26 
 
 
536 aa  414  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  47.07 
 
 
536 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  47.07 
 
 
536 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  47.28 
 
 
536 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  47.28 
 
 
536 aa  414  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  47.31 
 
 
536 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  46.65 
 
 
536 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  47.21 
 
 
535 aa  411  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  47.11 
 
 
536 aa  412  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  46.49 
 
 
535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  44.42 
 
 
535 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  44.66 
 
 
536 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0583  thiamine transporter membrane protein  47.07 
 
 
537 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  39.45 
 
 
514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  38.9 
 
 
543 aa  324  2e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3108  thiamine transporter membrane protein  41.9 
 
 
531 aa  323  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 
509 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1141  thiamine transporter membrane protein  41.13 
 
 
541 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.661169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3260  thiamine transporter membrane protein  37.89 
 
 
545 aa  294  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4267  thiamine transporter membrane protein  38.24 
 
 
542 aa  278  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2799  thiamine transporter membrane protein  37.31 
 
 
504 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
555 aa  251  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1392  thiamine transporter membrane protein  38.8 
 
 
504 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  34.82 
 
 
521 aa  249  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  37.53 
 
 
523 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0059  thiamine transporter membrane protein  38.8 
 
 
504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.78 
 
 
606 aa  115  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 
572 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.53 
 
 
663 aa  101  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.62 
 
 
565 aa  100  7e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 
550 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.68 
 
 
564 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.35 
 
 
510 aa  95.5  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.42 
 
 
515 aa  93.6  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
597 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.78 
 
 
634 aa  85.1  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2821  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.46 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000164471  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2546  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.31 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.78 
 
 
579 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.17 
 
 
576 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1438  iron compound ABC transporter, permease protein, putative  21 
 
 
583 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1238  iron compound ABC transporter permease  21 
 
 
552 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1413  putative iron compound ABC transporter, permease protein  21 
 
 
585 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1214  iron ABC transporter permease  21 
 
 
583 aa  77  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  21.44 
 
 
560 aa  76.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.16 
 
 
259 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3968  putative iron compound ABC transporter, permease protein  20.92 
 
 
585 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1479  putative 2-aminoethylphosphonate ABC transport system, permease protein  21 
 
 
545 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  28.76 
 
 
269 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5009  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.21 
 
 
574 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
512 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0257  NifC-like ABC-type porter  31.34 
 
 
270 aa  75.5  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1216  iron ABC transporter permease  21 
 
 
583 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.66 
 
 
551 aa  74.7  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.68 
 
 
572 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5136  ABC transporter, permease protein  24.36 
 
 
574 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.897571  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1239  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.92 
 
 
585 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3393  ABC opine/polyamine transporter, inner membrane subunit  27.27 
 
 
264 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.19 
 
 
544 aa  73.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.58 
 
 
585 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.27 
 
 
264 aa  73.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.645477  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.54 
 
 
540 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1376  putative iron compound ABC transporter, permease protein  21.33 
 
 
585 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3519  molybdate ABC transporter permease  30.89 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
528 aa  71.2  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2273  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.38 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.81 
 
 
576 aa  70.5  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0257  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
269 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.748764  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1758  NifC-like ABC-type porter  29.83 
 
 
260 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.78 
 
 
235 aa  70.1  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1924  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.32 
 
 
222 aa  69.3  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.91 
 
 
293 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1021  NifC-like ABC-type porter  29.28 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0506  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.44 
 
 
292 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.31 
 
 
677 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3985  molybdate ABC transporter permease  31.89 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108268  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  23.64 
 
 
547 aa  68.6  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.37 
 
 
532 aa  68.2  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0978  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  28.5 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.976242  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0923  NifC-like ABC-type porter  29.28 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3463  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  27.11 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00996182  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.63 
 
 
574 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1979  NifC-like ABC-type porter  29.84 
 
 
263 aa  67  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.200297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1306  molybdate ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
268 aa  67  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.606425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>