More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0456 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
509 aa  941    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0886  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.53 
 
 
518 aa  477  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.453337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 
528 aa  263  6.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.04 
 
 
550 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  36.03 
 
 
551 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.01 
 
 
572 aa  169  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
532 aa  163  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
565 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.26 
 
 
606 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
663 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
634 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
540 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.82 
 
 
547 aa  143  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
547 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
597 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  32.57 
 
 
576 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4912  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.57 
 
 
547 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.341081  normal  0.198477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
601 aa  123  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.21 
 
 
545 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1108  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.56 
 
 
545 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.44 
 
 
543 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.36 
 
 
563 aa  103  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.85 
 
 
564 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1012  thiamine transporter membrane protein  25.51 
 
 
514 aa  97.8  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.775062  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.05 
 
 
572 aa  97.4  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1199  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  32.39 
 
 
555 aa  97.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.60189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4451  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.41 
 
 
586 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.457212  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.4 
 
 
544 aa  94.7  3e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0741111  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04850  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  25.84 
 
 
587 aa  93.6  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  25.73 
 
 
530 aa  92.8  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1043  ABC transporter, fused inner membrane subunits  30.51 
 
 
589 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0498706  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.55 
 
 
551 aa  92.4  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
561 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  24.65 
 
 
560 aa  90.9  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
589 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35666  normal  0.522128 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001685  thiamin ABC transporter transmembrane component  26.08 
 
 
516 aa  90.1  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  26.25 
 
 
516 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1726  iron, putative  29.6 
 
 
585 aa  89.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0368916  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0950  ABC transporter, permease protein  31.15 
 
 
589 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
544 aa  89.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4361  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.22 
 
 
590 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3274  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
590 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.312998  normal  0.625588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
590 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
590 aa  88.2  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297205  normal  0.0450564 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.79 
 
 
576 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.57335  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1768  ABC Fe3+ siderophore transporter, inner membrane subunit  31 
 
 
590 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606838  normal  0.0413415 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  26.48 
 
 
509 aa  87.8  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
590 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1035  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  30.93 
 
 
589 aa  87.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4139  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.75 
 
 
590 aa  87  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167103  normal  0.195265 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2275  putative transmembrane ABC transporter protein  30.93 
 
 
589 aa  86.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  36.31 
 
 
592 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0386  thiamine transporter membrane protein  25.45 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.127364  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.7 
 
 
515 aa  84  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
565 aa  84  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4938  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.78 
 
 
521 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4882  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.1 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0925  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.51 
 
 
554 aa  81.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
569 aa  81.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4762  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 
521 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109676  normal  0.504386 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0007  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.93 
 
 
512 aa  80.5  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000649932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
292 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.470729 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2480  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 
564 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.983749 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0282  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.24 
 
 
569 aa  79  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.49 
 
 
569 aa  79  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 
579 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.236914  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1686  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.87 
 
 
292 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1611  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.67 
 
 
290 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.146583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07120  carbohydrate ABC transporter membrane protein  28.34 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.11 
 
 
563 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.97 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.306063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0112  ABC transporter, permease protein  30.75 
 
 
597 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 
543 aa  77.4  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.68 
 
 
545 aa  77.4  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.102963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  36.26 
 
 
231 aa  77  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4847  ABC transporter, inner membrane subunit  28.37 
 
 
289 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131167  decreased coverage  0.000130269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  36.02 
 
 
228 aa  77  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  36.26 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0376  ABC transporter, permease protein, putative  24.11 
 
 
539 aa  76.6  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0514897  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.36 
 
 
575 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.66 
 
 
290 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.865524  normal  0.148695 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  35.48 
 
 
229 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  34.02 
 
 
233 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  36.26 
 
 
231 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  27.29 
 
 
574 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4009  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.22 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0664  molybdate ABC transporter permease protein  34.95 
 
 
232 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.29 
 
 
669 aa  75.1  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2355  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.74 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0236237  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.05 
 
 
551 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
510 aa  75.1  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2822  molybdate ABC transporter permease protein  32.97 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.825373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.15 
 
 
278 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1480  ABC transporter, permease protein  27.24 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00172714  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  27.89 
 
 
535 aa  74.3  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  36.55 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  32.99 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4672  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.78 
 
 
521 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.548778 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>