More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0219 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0219  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
601 aa  1114    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0744847  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.57 
 
 
565 aa  617  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04170  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  69.69 
 
 
592 aa  611  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0420701  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.85 
 
 
572 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000013975  decreased coverage  0.00476885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.88 
 
 
569 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19470  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  55.3 
 
 
576 aa  455  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.51 
 
 
544 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.10733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04590  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  56.93 
 
 
551 aa  447  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31200  ABC-type Fe3+ transport system, permease component  54.26 
 
 
547 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.393839  normal  0.564354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.66 
 
 
547 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.99 
 
 
532 aa  338  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.763133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
540 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.666018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.68 
 
 
564 aa  278  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.957532  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
606 aa  200  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.99 
 
 
565 aa  189  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
663 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.745838  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
597 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
634 aa  166  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
528 aa  153  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.402791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3245  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.54 
 
 
550 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
509 aa  148  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.553789  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1808  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.55 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0487  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.53 
 
 
515 aa  138  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0614  thiamine transporter membrane protein  26.39 
 
 
536 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.012901 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0111  thiamine transporter membrane protein  27.95 
 
 
536 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0118  thiamine transporter membrane protein  27.95 
 
 
536 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0333218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0114  thiamine transporter membrane protein  27.95 
 
 
536 aa  121  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.576888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0071  thiamine transporter membrane protein  27.29 
 
 
536 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0113  thiamine transporter membrane protein  27.95 
 
 
536 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.195449 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3590  thiamine transporter membrane protein  27.08 
 
 
536 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.838581  hitchhiker  0.00000463415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0071  thiamine transporter membrane protein  27.5 
 
 
536 aa  120  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.818645  normal  0.387113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0069  thiamine transporter membrane protein  27.5 
 
 
536 aa  120  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0118  thiamine transporter membrane protein  27.95 
 
 
536 aa  120  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0072  thiamine transporter membrane protein  27.29 
 
 
536 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00069  thiamin ABC transporter membrane protein  27.58 
 
 
536 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3532  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  27.88 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00068  hypothetical protein  27.58 
 
 
536 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.65 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.859078  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0059  thiamine transporter membrane protein  27.29 
 
 
536 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2944  thiamine transporter membrane protein  26.49 
 
 
535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.305825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2689  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  37.92 
 
 
269 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.549789 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3543  thiamine transporter membrane protein  26.49 
 
 
535 aa  116  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3415  thiamine transporter membrane protein  26.49 
 
 
535 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.87 
 
 
569 aa  113  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.290045  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3620  thiamine transporter membrane protein  26.69 
 
 
535 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3809  thiamine transporter membrane protein  26.48 
 
 
535 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.81 
 
 
742 aa  110  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.151959  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.53 
 
 
564 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.108646 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
563 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4019  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.35 
 
 
275 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.392742  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1543  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.27 
 
 
550 aa  108  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.13 
 
 
743 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0216249 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2759  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.34 
 
 
278 aa  108  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.16 
 
 
740 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113948  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3559  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.95 
 
 
278 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.04 
 
 
550 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 
561 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.488219  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2817  thiamine transporter membrane protein  29.62 
 
 
523 aa  105  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229213  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0966  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.56 
 
 
279 aa  105  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0105  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.82 
 
 
288 aa  104  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0108  sulfate ABC transporter, permease protein  32.17 
 
 
288 aa  104  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.368477  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1397  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  32.35 
 
 
275 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1758  thiamine transporter membrane protein  27.02 
 
 
543 aa  103  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.000432752  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1553  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  29.85 
 
 
277 aa  103  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.04 
 
 
741 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.885166  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2118  thiamine transporter membrane protein  26.3 
 
 
530 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0144  thiamine ABC transporter, permease protein  24.38 
 
 
560 aa  101  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.997679  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0736  thiamine transporter membrane protein  26.5 
 
 
535 aa  102  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3471  thiamine ABC transporter, inner membrane subunit  26.36 
 
 
509 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
579 aa  101  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.434038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2477  ABC-type transporter permease protein  22.35 
 
 
564 aa  101  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174781  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1329  sulfate ABC transporter, permease protein, putative  30.45 
 
 
288 aa  100  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0287943  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0624  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  32.24 
 
 
278 aa  100  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1289  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.42 
 
 
288 aa  100  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1046  sulfate ABC transporter, permease protein CysT  31.78 
 
 
308 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4045  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.25 
 
 
271 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.101358  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1855  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.85 
 
 
273 aa  100  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.174317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4589  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.38 
 
 
308 aa  99.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6976  sulfate/thiosulfate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
277 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2546  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  28.88 
 
 
291 aa  100  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.09 
 
 
551 aa  99.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0820  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  31.03 
 
 
278 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.073979  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0719  ABC transporter, permease protein  25.26 
 
 
741 aa  99  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00789  thiamine transporter membrane protein  24.51 
 
 
516 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1377  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.88 
 
 
275 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0350  thiamine transporter membrane protein  25.15 
 
 
540 aa  98.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1157  Sulfate ABC transporter, permease protein CysT  30.38 
 
 
279 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.76 
 
 
543 aa  98.2  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.122368  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2558  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.72 
 
 
293 aa  98.2  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.000169531  normal  0.108126 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0329  thiamine transporter membrane protein  28.24 
 
 
521 aa  97.8  5e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.356206 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4879  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.74 
 
 
677 aa  97.8  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.426175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0867  sulfate ABC transporter, inner membrane subunit CysT  29.67 
 
 
289 aa  97.4  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2768  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.76 
 
 
277 aa  97.4  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128894 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1409  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.76 
 
 
277 aa  97.4  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0622  thiamine transporter membrane protein  26.65 
 
 
536 aa  97.4  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1300  sulfate/thiosulfate transporter subunit  31.76 
 
 
277 aa  97.4  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0327  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.32 
 
 
273 aa  97.1  8e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0249986  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1949  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.89 
 
 
259 aa  97.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0675  ABC transporter, permease protein  25.26 
 
 
741 aa  97.1  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4969  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  38.04 
 
 
271 aa  97.1  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>