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for query gene Nham_2645 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  91.19 
 
 		 430 aa  739    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  100 
 
 		 420 aa  828    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  62.65 
 
 		 414 aa  522  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4899  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  47.16 
 
 		 422 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.3 
 
 		 421 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1935  MFS permease  47.86 
 
 		 401 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1940  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.32 
 
 		 415 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00164686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2392  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.75 
 
 		 421 aa  342  7e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  48.06 
 
 		 421 aa  342  9e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  46.25 
 
 		 401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4830  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.75 
 
 		 418 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1509  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  46.82 
 
 		 412 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.348648  normal  0.383449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1941  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  42.68 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.198453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2134  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.06 
 
 		 430 aa  311  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.352215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1106  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  45.45 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132258  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2151  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 426 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0080  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0753  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  43.4 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.514561 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.09 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3226  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.68 
 
 		 428 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0797975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3420  major facilitator transporter  41.12 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0152317  normal  0.778577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1272  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.01 
 
 		 415 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313139  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3729  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 		 461 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.467675  normal  0.205198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2971  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  42.03 
 
 		 410 aa  286  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1510  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 437 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  0.740709 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1929  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  41.67 
 
 		 422 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00455399  hitchhiker  0.000000256479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3613  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.389227  normal  0.058593 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.27 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.782592  normal  0.504854 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2385  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  40.31 
 
 		 414 aa  272  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.226188 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1501  major facilitator transporter  39.34 
 
 		 405 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0331967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1442  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  39.1 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0246782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2851  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  39.1 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.724054  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.31 
 
 		 425 aa  263  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0688  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  39.38 
 
 		 398 aa  263  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.593679 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3362  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.61 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1559  major facilitator superfamily transporter  38.48 
 
 		 402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.23279 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1348  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 407 aa  252  8.000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.44 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1778  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  38.21 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10238  bicyclomycin resistance protein  34.27 
 
 		 406 aa  235  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04022  bicyclomycin resistance protein  34.18 
 
 		 416 aa  233  5e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4258  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.99 
 
 		 410 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1823  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.536913 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.1 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1682  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.1 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0153282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0843  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.62 
 
 		 424 aa  192  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2434  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.15 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.71242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0264  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.05 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0833  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.59 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1509  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.426871 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4067  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.23672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0824  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.31 
 
 		 434 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  35.25 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0485  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.31 
 
 		 458 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0964  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.31 
 
 		 405 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0925  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.03 
 
 		 405 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  34.69 
 
 		 412 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5745  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.57 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4752  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter Bcr/CflA subfamily  30.75 
 
 		 426 aa  172  6.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.328295 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.73 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1571  MFS family transporter  32.2 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18090  major facilitator subfamily transporter protein  32.2 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3432  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.07 
 
 		 438 aa  169  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00363219  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  35.31 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2346  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.75 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2017  bicyclomycin resistance protein  33.42 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.470067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.16 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0664  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.8 
 
 		 401 aa  159  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.69 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1904  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  38.89 
 
 		 425 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1546  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.96 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20220  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.83 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.179817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3614  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  33.43 
 
 		 407 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1702  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.87 
 
 		 412 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0167  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.79 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4036  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.36 
 
 		 406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.08 
 
 		 418 aa  155  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003780  permease  32.28 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.142338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1659  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.64 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.66 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  30.43 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0634  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.47 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000940614 
 
 
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NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.35 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2139  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.21 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.935322  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_3061  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.21 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_3096  major facilitator transporter  33.21 
 
 		 411 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2605  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.21 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.05 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.21 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0772  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.21 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_3008  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.21 
 
 		 411 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.3 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_2001  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.05 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0443671  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_0589  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  30.96 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0628  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.96 
 
 		 393 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00837231  normal  0.960264 
 
 
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NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.29 
 
 		 412 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_0876  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.03 
 
 		 405 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.453625  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4575  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.7 
 
 		 393 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180506  normal  0.0143089 
 
 
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