More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0077 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0077  exosome complex exonuclease Rrp41  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.206414  hitchhiker  0.00426445 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1792  exosome complex exonuclease 1  74.59 
 
 		 245 aa  396  1e-109  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0933  exosome complex exonuclease Rrp41  56.61 
 
 		 246 aa  281  8.000000000000001e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1381  exosome complex exonuclease Rrp41  54.96 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0581  exosome complex exonuclease 1  55.32 
 
 		 245 aa  280  2e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0836  exosome complex exonuclease Rrp41  53.31 
 
 		 246 aa  279  2e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.903735  normal  0.0904415 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1362  exosome complex exonuclease Rrp41  55.19 
 
 		 245 aa  277  1e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0182  exosome complex exonuclease 1  55.17 
 
 		 245 aa  273  3e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000282409  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0167  exosome complex exonuclease 1  51.05 
 
 		 242 aa  271  9e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000393056  normal  0.0873038 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0432  exosome complex exonuclease 1  51.53 
 
 		 244 aa  266  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0114185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2506  exosome complex exonuclease 1  54.08 
 
 		 501 aa  265  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.118322  normal  0.461906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0199  exosome complex exonuclease Rrp41  53.78 
 
 		 343 aa  265  5e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000449737  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1937  exosome complex exonuclease Rrp41  57.98 
 
 		 246 aa  263  3e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23286  predicted protein  31.25 
 
 		 274 aa  120  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6110  ribonuclease PH  34.31 
 
 		 239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70420  ribonuclease PH  33.89 
 
 		 239 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5342  ribonuclease PH  34.44 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.452896  normal  0.0235575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02850  ribonuclease PH  33.33 
 
 		 239 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4386  ribonuclease PH  34.58 
 
 		 239 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0782226 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38006  predicted protein  33.62 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0179  ribonuclease PH  34.44 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308415  hitchhiker  0.00000767641 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4389  ribonuclease PH  34.6 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000316498  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0523  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5294  ribonuclease PH  34.02 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.475514 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5202  ribonuclease PH  34.02 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.883526  normal  0.399595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5547  ribonuclease PH  34.44 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1952  ribonuclease PH  32.22 
 
 		 258 aa  111  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00230423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3622  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 244 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0193731  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2684  ribonuclease PH  33.61 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0123009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0551  ribonuclease PH  34.31 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1338  ribonuclease PH  34.18 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1960  ribonuclease PH  32.92 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0244748  normal  0.445772 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0213  ribonuclease PH  33.2 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2280  ribonuclease PH  32.92 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.865381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0077  ribonuclease PH  32.78 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2159  ribonuclease PH  32.92 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0019254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0188  ribonuclease PH  33.2 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00190846  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4361  ribonuclease PH  32.23 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.889932  hitchhiker  0.00892611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0667  ribonuclease PH  32.51 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0112  ribonuclease PH  33.47 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0634  ribonuclease PH  32.65 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000189888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1532  ribonuclease PH  31.71 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000668093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0850  ribonuclease PH  32.26 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0548  ribonuclease PH  31.8 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4586  ribonuclease PH  32.24 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.410943  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0845  ribonuclease PH  31.8 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4377  ribonuclease PH  32.24 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0247337  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4218  ribonuclease PH  32.24 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00495722  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4234  ribonuclease PH  32.24 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3087  ribonuclease PH  31.45 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4571  ribonuclease PH  32.24 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4621  ribonuclease PH  32.24 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0007934  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0758  ribonuclease PH  31.8 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1950  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.29 
 
 		 740 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.139447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4715  ribonuclease PH  32.24 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000515992  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3683  ribonuclease PH  32.5 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0449428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0837  ribonuclease PH  32.49 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0066  ribonuclease PH  33.19 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0903  ribonuclease PH  32.1 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.398117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0320  ribonuclease PH  34.33 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4601  ribonuclease PH  32.24 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0074165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2446  ribonuclease PH  31.8 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354995 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0332  ribonuclease PH  32.33 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0178765  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2403  ribonuclease PH  33.47 
 
 		 246 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0869  ribonuclease PH  33.05 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1057  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.71 
 
 		 701 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000971525  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0857  ribonuclease PH  33.05 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0519  ribonuclease PH  31.65 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000647915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0165  ribonuclease PH  31.3 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2581  ribonuclease PH  34.8 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0057942  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2600  ribonuclease PH  29.83 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09950  RNAse PH  33.76 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.296895  normal  0.201234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4016  ribonuclease PH  31.76 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.761364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0051  ribonuclease PH  30.13 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264051  normal  0.249454 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15390  ribonuclease PH  32.07 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.547924  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0957  ribonuclease PH  32.38 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.88797  normal  0.461387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2256  ribonuclease PH  31.95 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000012272  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0518  ribonuclease PH  32.38 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0997  ribonuclease PH  32.38 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.76 
 
 		 700 aa  99.8  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1294  ribonuclease PH  32.26 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2745  ribonuclease PH  31.8 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2313  ribonuclease PH  35.03 
 
 		 252 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000980644 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0392  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.79 
 
 		 693 aa  99  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05300  conserved hypothetical protein  31.91 
 
 		 262 aa  99  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.325732  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0395  ribonuclease PH  32.79 
 
 		 270 aa  99  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1629  ribonuclease PH  31.25 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.230363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07900  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  33.47 
 
 		 705 aa  99  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3206  ribonuclease PH  30.71 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0395  ribonuclease PH  31.03 
 
 		 237 aa  98.6  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1314  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  31.65 
 
 		 772 aa  98.2  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.122367  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3024  ribonuclease PH  31.8 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4210  ribonuclease PH  33.47 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.959697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08370  RNAse PH  33.05 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0151  ribonuclease PH  31.9 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0719  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30.99 
 
 		 752 aa  97.8  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000106259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0186  ribonuclease PH  31.47 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1865  ribonuclease PH  30.54 
 
 		 238 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0425  ribonuclease PH  31.74 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1684  ribonuclease PH  31.38 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00193197  hitchhiker  0.00000164125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>