225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4555 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  100 
 
 		 452 aa  905    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  40 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  41.36 
 
 		 435 aa  272  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  33.91 
 
 		 427 aa  199  6e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  32.55 
 
 		 422 aa  196  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  33.74 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  32.49 
 
 		 426 aa  190  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  31.5 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  29.48 
 
 		 436 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  33.03 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  32.9 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  31.27 
 
 		 411 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  30.71 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 410 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  26.25 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  27.3 
 
 		 415 aa  119  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  27.04 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  27.19 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  27.58 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  27.01 
 
 		 425 aa  87  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  43.22 
 
 		 200 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  26.56 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  40.54 
 
 		 219 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  24.11 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 816 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0584  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.97 
 
 		 455 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.767498  normal  0.0809109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  42.02 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  26.76 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  23.89 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  38.66 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  37.7 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  37.7 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  36.42 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 247 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  41.18 
 
 		 221 aa  75.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  26.13 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  40.54 
 
 		 213 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  35.07 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  38.54 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  33.33 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  35.26 
 
 		 178 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  36.84 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  29.31 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  34.31 
 
 		 177 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  37.5 
 
 		 196 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  34.19 
 
 		 193 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  37.09 
 
 		 220 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  37.04 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  24.55 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  26.43 
 
 		 451 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  33.56 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2542  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  30.43 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  28.95 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  37.04 
 
 		 190 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  31.13 
 
 		 185 aa  66.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  35.21 
 
 		 184 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0246  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.1 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.777594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 189 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  39.5 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0040  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  28.65 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0639189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  41.25 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  32.77 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  35.19 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  28.69 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4337  putative toxin/protease secretion system  23.56 
 
 		 661 aa  63.2  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 192 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3318  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  27.98 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  34.11 
 
 		 187 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  29.87 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 192 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  34.31 
 
 		 192 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  37.9 
 
 		 205 aa  62.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  26.34 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0275  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.62 
 
 		 481 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2967  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.98 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.34356  normal  0.656863 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  32.77 
 
 		 191 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  40 
 
 		 178 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2740  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.98 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  23.75 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  31.17 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  30.88 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1643  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  28.28 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4712  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  26.54 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.531002  normal  0.0413693 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  25.56 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  37.01 
 
 		 177 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3973  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.94 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2544  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  28.41 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.110449  normal  0.225812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0114  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.16 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0685446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  26.14 
 
 		 501 aa  56.6  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3509  polysaccharide export protein  32.89 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000101119 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  30.09 
 
 		 196 aa  55.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>