63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4073 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  961    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  29.03 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  24.07 
 
 		 370 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  37.27 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  41.94 
 
 		 410 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  27.24 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  40.43 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  24.36 
 
 		 427 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  44 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  26.94 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  25.85 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  26.42 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  28 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  27.18 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  25.75 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  24.31 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  24.31 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  24.21 
 
 		 461 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  34.41 
 
 		 196 aa  56.2  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  34.41 
 
 		 195 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  36.17 
 
 		 191 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  28.26 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  33.11 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  36.17 
 
 		 191 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  23.72 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  37.23 
 
 		 191 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 196 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  21.89 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  26.53 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  32.14 
 
 		 193 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  37.76 
 
 		 221 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  32.98 
 
 		 175 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  36.73 
 
 		 451 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  32.99 
 
 		 189 aa  51.2  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  24.66 
 
 		 417 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  26.79 
 
 		 435 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  35.05 
 
 		 208 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 200 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  32 
 
 		 238 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  32 
 
 		 277 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  32.29 
 
 		 196 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  27.23 
 
 		 423 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  24.39 
 
 		 816 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  32.32 
 
 		 495 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  32.32 
 
 		 495 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.11 
 
 		 193 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  34.69 
 
 		 219 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  27.34 
 
 		 551 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  30.52 
 
 		 216 aa  46.2  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  23.58 
 
 		 434 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 192 aa  44.3  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.12 
 
 		 473 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  32.32 
 
 		 192 aa  44.3  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  32.32 
 
 		 192 aa  44.3  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  32.99 
 
 		 195 aa  43.9  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  36.73 
 
 		 234 aa  43.9  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  30 
 
 		 247 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  28.04 
 
 		 153 aa  43.9  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>