122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6739 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  100 
 
 
370 aa  746    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  35.45 
 
 
529 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  25.46 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  27.93 
 
 
439 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  27.3 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  34.97 
 
 
455 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  26.76 
 
 
452 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  24.65 
 
 
442 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  26.34 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4073  hypothetical protein  23.65 
 
 
501 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000220985  normal  0.0992314 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  23.98 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  24.94 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  26.96 
 
 
422 aa  72.4  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  24.59 
 
 
419 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  39.29 
 
 
205 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  29.39 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  28.32 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  28.32 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  22.82 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  33.09 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  33.09 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  22.66 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  37.14 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  33.09 
 
 
196 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  39.22 
 
 
219 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  21.89 
 
 
436 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  34.29 
 
 
193 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  22.43 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  22.16 
 
 
415 aa  60.8  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  21.47 
 
 
427 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  37.25 
 
 
247 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  33.61 
 
 
191 aa  60.1  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
187 aa  59.7  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  37.11 
 
 
177 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  21.61 
 
 
816 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  34.62 
 
 
208 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  31.52 
 
 
200 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  35.05 
 
 
234 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  35.05 
 
 
235 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  32.48 
 
 
221 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  25.2 
 
 
441 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  31.62 
 
 
189 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  35.05 
 
 
235 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  36.27 
 
 
213 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  32.14 
 
 
191 aa  56.6  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  35.87 
 
 
461 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  36.27 
 
 
238 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  37.5 
 
 
152 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  31.25 
 
 
191 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  34.78 
 
 
178 aa  55.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  30.71 
 
 
495 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  31.62 
 
 
435 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  33.7 
 
 
459 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  30.71 
 
 
495 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  37.25 
 
 
196 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  28.87 
 
 
410 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  29.11 
 
 
376 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  33.96 
 
 
175 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  30 
 
 
186 aa  53.9  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  24.73 
 
 
425 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  28.44 
 
 
185 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  30.91 
 
 
153 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  28.85 
 
 
451 aa  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  32.38 
 
 
216 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  36.27 
 
 
220 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  28.85 
 
 
451 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  31.68 
 
 
192 aa  50.8  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  23.36 
 
 
417 aa  50.4  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  34 
 
 
495 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  29 
 
 
185 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  31.4 
 
 
206 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  34.88 
 
 
178 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0428  polysaccharide export protein  34.65 
 
 
202 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0542078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  38.1 
 
 
253 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  28.72 
 
 
185 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  29.87 
 
 
376 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  31.03 
 
 
237 aa  47.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  31.48 
 
 
184 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.37 
 
 
373 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.96 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17951  hypothetical protein  26.42 
 
 
417 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2618  polysaccharide export protein  29.03 
 
 
193 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676482  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  21.66 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  26.42 
 
 
192 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  31.58 
 
 
229 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  27.13 
 
 
277 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  31.96 
 
 
192 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  22.56 
 
 
429 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  31.96 
 
 
192 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  29.63 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  31.65 
 
 
473 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  31.96 
 
 
192 aa  45.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  30.58 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.83 
 
 
446 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  25.79 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  35.16 
 
 
270 aa  44.7  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.83 
 
 
400 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.83 
 
 
422 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  33.71 
 
 
177 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88532  predicted protein  24.73 
 
 
3608 aa  43.9  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.478087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>